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タイトルMolecular mechanism of dynein-dynactin complex assembly by LIS1.
ジャーナル・号・ページScience, Vol. 383, Issue 6690, Page eadk8544, Year 2024
掲載日2024年3月29日
著者Kashish Singh / Clinton K Lau / Giulia Manigrasso / José B Gama / Reto Gassmann / Andrew P Carter /
PubMed 要旨Cytoplasmic dynein is a microtubule motor vital for cellular organization and division. It functions as a ~4-megadalton complex containing its cofactor dynactin and a cargo-specific coiled-coil ...Cytoplasmic dynein is a microtubule motor vital for cellular organization and division. It functions as a ~4-megadalton complex containing its cofactor dynactin and a cargo-specific coiled-coil adaptor. However, how dynein and dynactin recognize diverse adaptors, how they interact with each other during complex formation, and the role of critical regulators such as lissencephaly-1 (LIS1) protein (LIS1) remain unclear. In this study, we determined the cryo-electron microscopy structure of dynein-dynactin on microtubules with LIS1 and the lysosomal adaptor JIP3. This structure reveals the molecular basis of interactions occurring during dynein activation. We show how JIP3 activates dynein despite its atypical architecture. Unexpectedly, LIS1 binds dynactin's p150 subunit, tethering it along the length of dynein. Our data suggest that LIS1 and p150 constrain dynein-dynactin to ensure efficient complex formation.
リンクScience / PubMed:38547289 / PubMed Central
手法EM (単粒子)
解像度3.5 - 10.0 Å
構造データ

EMDB-17825, PDB-8pqv:
Cytoplasmic dynein-1 motor domain in post-powerstroke state
手法: EM (単粒子) / 解像度: 4.0 Å

EMDB-17826, PDB-8pqw:
Cytoplasmic dynein-1 motor domain bound to dynactin-p150glued and LIS1
手法: EM (単粒子) / 解像度: 4.2 Å

EMDB-17828, PDB-8pqy:
Cytoplasmic dynein-1 motor domain bound to LIS1
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.8 Å

EMDB-17829, PDB-8pqz:
Cytoplasmic dynein-1 A1/A2 motor domains bound to LIS1
手法: EM (単粒子) / 解像度: 5.5 Å

EMDB-17830, PDB-8pr0:
Cytoplasmic dynein-A heavy chain bound to dynactin-p150glued and IC-LC tower
手法: EM (単粒子) / 解像度: 9.4 Å

EMDB-17831, PDB-8pr1:
Cytoplasmic dynein-B heavy chain bound to IC-LC tower
手法: EM (単粒子) / 解像度: 8.2 Å

EMDB-17832, PDB-8pr2:
Cytoplasmic dynein-1 heavy chain bound to JIP3-LZI
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.8 Å

EMDB-17833, PDB-8pr3:
Cytoplasmic dynein-1 heavy chain bound to JIP3-RH1
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.9 Å

EMDB-17834, PDB-8pr4:
Dynactin pointed end bound to JIP3
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.5 Å

EMDB-17835: Consensus cryo-EM structure of Dynein-Dynactin-JIP3(1-185)-LIS1
手法: EM (単粒子) / 解像度: 4.5 Å

EMDB-17836: Consensus cryo-EM structure of Dynein-dynactin-JIP3(1-560)-LIS1
手法: EM (単粒子) / 解像度: 4.9 Å

EMDB-17873, PDB-8ptk:
Composite structure of Dynein-Dynactin-JIP3-LIS1
手法: EM (単粒子) / 解像度: 10.0 Å

PDB-8pr5:
Structure of the autoinhibited dynactin p150glued projection
手法: ELECTRON MICROSCOPY / 解像度: 8.6 Å

化合物

ChemComp-ADP:
ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE / ADP / ADP, エネルギー貯蔵分子*YM / アデノシン二リン酸

ChemComp-MG:
Unknown entry / マグネシウムジカチオン

ChemComp-ATP:
ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE / ATP / ATP, エネルギー貯蔵分子*YM / アデノシン三リン酸

ChemComp-ZN:
Unknown entry

ChemComp-ANP:
PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER / AMP-PNP / AMP-PNP, エネルギー貯蔵分子類似体*YM

由来
  • homo sapiens (ヒト)
  • sus scrofa (ブタ)
キーワードMOTOR PROTEIN (モータータンパク質) / Dynein (ダイニン) / AAA-Atpase / p150 / LIS1 / dynactin (ダイナクチン) / LC8 / TCTEX1 / JIP3

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EMN文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2021年10月5日: 温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

  • 2021年のノーベル医学・生理学賞は、温度と触覚の受容体を発見したデビッド・ジュリアスとアーデム・パタポウティアンに共同で授与されました
  • EM Navigatorでは、両先駆者によるクライオEM構造データを見つけることができます

外部リンク:The Nobel Prize in Physiology or Medicine 2021 - NobelPrize.org / Structure data by Ardem Patapoutian / Structure data by David Julius

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月:コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

テキストデータのダウンロード

EM Navigatorの以下のサービスのデータが、テキスト形式でダウンロードできるようになりました。ダウンロードしたデータをExcelなどで読み込むことができます。

ページデータフォーマット
EM Navigator 検索検索結果CSV, TSV, JSON
EM Navigator 統計情報表データCSV, TSV

関連情報:EMN検索 / EMN統計情報

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3DEM構造データから引用されている文献のデータベース

  • EMDDBとPDBの3次元電子顕微鏡エントリから引用されている文献のデータベースです。
  • PubMedのデータを利用しています。

関連情報:EMDB / PDB / Q: EM Navigatorの情報源は? / EM Navigator / 万見文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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