[日本語] English
万見生物種
- EMDB/PDB/SASBDBの生物種情報 -

-
検索語

名称・Taxonomy-ID・キーワード:

-
生物種情報

和名 *1マイコバクテリウム・ツベルクローシス, 結核菌
名称 *2Mycobacterium tuberculosis
その他の名称 *2別称: Bacillus tuberculosis / Bacterium tuberculosis ...Bacillus tuberculosis / Bacterium tuberculosis / Mycobacterium tuberculosis typus humanus / Mycobacterium tuberculosis var. hominis / Mycobacterium tuberculosis (Zopf 1883) Lehmann and Neumann 1896 (Approved Lists 1980) / その他: ATCC 25618 / ATCC 27294 ...ATCC 25618 / ATCC 27294 / ATCC 9360 / "Bacillus tuberculosis" (Zopf 1883) Klein 1884 / "Bacterium tuberculosis" Zopf 1883 / CCUG 37357 / CCUG 38148 / CIP 104475 / CIP 64.31 / CNCTC 7301 / "Mycobacterium tuberculosis typus humanus" Lehmann and Neumann 1907 / "Mycobacterium tuberculosis var. hominis" Bergey et al. 1934 / NCTC 13144 / NCTC 7416 / strain H37 Rv / strain H37Rv
NCBI Taxonomy ID1773
系統 *2細胞生物 > 細菌 > テッラバクテリア > Actinomycetota > 放線菌目 > Mycobacteriales > マイコバクテリウム科 > マイコバクテリウム属 > Mycobacterium tuberculosis complex
ウィキペディア
ウィキペディア - 結核菌: 結核菌（けっかくきん、Mycobacterium tuberculosis、ヒト型結核菌）は、ヒトの結核の原因となる細菌。1882年3月24日、細菌学者ロベルト・コッホにより発見された...
コメントバクテリア
出典*1: DBCLSメタ用語集-翻訳用テーブル-学名と和名の対応 ライフサイエンス統合データベースプロジェクト
*2: NCBI Taxonomy

-
EMDB エントリ (123)

-
PDB エントリ (2239)

-
SASBDB エントリ (11)

全11件を表示しています

SASDD88

SASDDD8

SASDDQ8

SASDDT2

SASDDV2

SASDDW2
SASBDBエントリ 画像なし

SASDDX2

SASDEW3

SASDEX3
SASBDBエントリ 画像なし

SASDFG6

SASDFH6
SASBDBエントリ 画像なし

+
万見生物種について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

-
万見生物種

EMDB/PDB/SASBDBの生物種情報

EMDB/PDB/SASBDBの構造データの試料情報、由来する生物種に関するデータベース

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

他の情報も見る