+Open data
-Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 4poq | ||||||
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Title | Structure of unliganded VP1 pentamer of Human Polyomavirus 9 | ||||||
Components | VP1 | ||||||
Keywords | VIRAL PROTEIN / jelly roll fold / capsid formation / receptor interaction / carbohydrate / sialyloligosaccharide / viral coat protein | ||||||
Function / homology | Function and homology information T=7 icosahedral viral capsid / host cell nucleus / virion attachment to host cell / structural molecule activity / metal ion binding Similarity search - Function | ||||||
Biological species | Human polyomavirus 9 | ||||||
Method | X-RAY DIFFRACTION / SYNCHROTRON / MOLECULAR REPLACEMENT / Resolution: 2 Å | ||||||
Authors | Khan, Z.M. / Stehle, T. | ||||||
Citation | Journal: J.Virol. / Year: 2014 Title: Crystallographic and glycan microarray analysis of human polyomavirus 9 VP1 identifies N-glycolyl neuraminic acid as a receptor candidate. Authors: Khan, Z.M. / Liu, Y. / Neu, U. / Gilbert, M. / Ehlers, B. / Feizi, T. / Stehle, T. | ||||||
History |
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-Structure visualization
Structure viewer | Molecule: MolmilJmol/JSmol |
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-Downloads & links
-Download
PDBx/mmCIF format | 4poq.cif.gz | 1 MB | Display | PDBx/mmCIF format |
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PDB format | pdb4poq.ent.gz | 877.4 KB | Display | PDB format |
PDBx/mmJSON format | 4poq.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
Others | Other downloads |
-Validation report
Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/po/4poq ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/po/4poq | HTTPS FTP |
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-Related structure data
Related structure data | 4porC 4posC 4potC 4mbxS S: Starting model for refinement C: citing same article (ref.) |
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Similar structure data |
-Links
-Assembly
Deposited unit |
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Unit cell |
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Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
NCS domain segments: Ens-ID: 1 / Refine code: 5
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