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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2m3t | ||||||
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タイトル | Solution-state NMR structure of wild-type human gamma(S)-crystallin | ||||||
要素 | Beta-crystallin S | ||||||
キーワード | STRUCTURAL PROTEIN (タンパク質) / gamma-S / eye lens / aggregation / crystallin (クリスタリン) / cataract (白内障) / CRYGS | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 structural constituent of eye lens / lens development in camera-type eye / 視覚 / morphogenesis of an epithelium 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Homo sapiens (ヒト) | ||||||
手法 | 溶液NMR / simulated annealing | ||||||
Model details | minimized average structure, model 1 | ||||||
Model type details | minimized average | ||||||
データ登録者 | Brubaker, W.D. / Martin, R.W. | ||||||
引用 | ジャーナル: Structure / 年: 2013 タイトル: Preferential and Specific Binding of Human alpha B-Crystallin to a Cataract-Related Variant of gamma S-Crystallin. 著者: Kingsley, C.N. / Brubaker, W.D. / Markovic, S. / Diehl, A. / Brindley, A.J. / Oschkinat, H. / Martin, R.W. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 2m3t.cif.gz | 1.1 MB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb2m3t.ent.gz | 978.4 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 2m3t.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/m3/2m3t ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/m3/2m3t | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 20959.633 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: CRYGS, GRYG8 / Variant: Wild-Type / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): Rosetta (DE3) / 参照: UniProt: P22914 |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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-試料調製
詳細 |
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試料 |
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試料状態 |
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-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Varian INOVA / 製造業者: Varian / モデル: INOVA / 磁場強度: 800 MHz |
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-解析
NMR software |
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精密化 | 手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NMR constraints | NOE constraints total: 7444 / NOE intraresidue total count: 1547 / NOE long range total count: 3052 / NOE medium range total count: 1286 / NOE sequential total count: 1559 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: minimized average structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 200 / 登録したコンフォーマーの数: 21 |