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タイトルCyanotriazoles are selective topoisomerase II poisons that rapidly cure trypanosome infections.
ジャーナル・号・ページScience, Vol. 380, Issue 6652, Page 1349-1356, Year 2023
掲載日2023年6月30日
著者Srinivasa P S Rao / Matthew K Gould / Jonas Noeske / Manuel Saldivia / Rajiv S Jumani / Pearly S Ng / Olivier René / Yen-Liang Chen / Marcel Kaiser / Ryan Ritchie / Amanda Fortes Francisco / Nila Johnson / Debjani Patra / Harry Cheung / Colin Deniston / Andreas D Schenk / Wilian A Cortopassi / Remo S Schmidt / Natalie Wiedemar / Bryanna Thomas / Rima Palkar / Nahdiyah A Ghafar / Vanessa Manoharan / Catherine Luu / Jonathan E Gable / Kah Fei Wan / Elmarie Myburgh / Jeremy C Mottram / Whitney Barnes / John Walker / Charles Wartchow / Natasha Aziz / Colin Osborne / Juergen Wagner / Christopher Sarko / John M Kelly / Ujjini H Manjunatha / Pascal Mäser / Jan Jiricek / Suresh B Lakshminarayana / Michael P Barrett / Thierry T Diagana /
PubMed 要旨Millions who live in Latin America and sub-Saharan Africa are at risk of trypanosomatid infections, which cause Chagas disease and human African trypanosomiasis (HAT). Improved HAT treatments are ...Millions who live in Latin America and sub-Saharan Africa are at risk of trypanosomatid infections, which cause Chagas disease and human African trypanosomiasis (HAT). Improved HAT treatments are available, but Chagas disease therapies rely on two nitroheterocycles, which suffer from lengthy drug regimens and safety concerns that cause frequent treatment discontinuation. We performed phenotypic screening against trypanosomes and identified a class of cyanotriazoles (CTs) with potent trypanocidal activity both in vitro and in mouse models of Chagas disease and HAT. Cryo-electron microscopy approaches confirmed that CT compounds acted through selective, irreversible inhibition of trypanosomal topoisomerase II by stabilizing double-stranded DNA:enzyme cleavage complexes. These findings suggest a potential approach toward successful therapeutics for the treatment of Chagas disease.
リンクScience / PubMed:37384702
手法EM (単粒子)
解像度2.94 Å
構造データ

EMDB-29930, PDB-8gcc:
T. cruzi topoisomerase II alpha bound to dsDNA and the covalent inhibitor CT1
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.94 Å

化合物

ChemComp-YWX:
2-{3-[(Z)-iminomethyl]-1H-1,2,4-triazol-1-yl}-1-{(3M)-3-[2-(trifluoromethyl)phenyl]-6H-pyrrolo[3,4-b]pyridin-6-yl}ethan-1-one

由来
  • Trypanosoma cruzi (クルーズトリパノソーマ)
  • escherichia coli (大腸菌)
  • trypanosoma cruzi strain cl brener (クルーズトリパノソーマ)
キーワードISOMERASE (異性化酵素) / Topoisomerase (DNAトポイソメラーゼ) / DNA binding protein (DNA結合タンパク質) / Topoisomerase inhibitor

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月:コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか? / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例:em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見文献

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関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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