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検索 (著者・登録者: ehara & h)の結果124件中、1から50件目までを表示しています

EMDB-35448:
Overlapping tri-nucleosome
手法: 単粒子 / : Nishimura M, Fujii T, Tanaka H, Maehara K, Nozawa K, Takizawa Y, Ohkawa Y, Kurumizaka H

PDB-8ihl:
Overlapping tri-nucleosome
手法: 単粒子 / : Nishimura M, Fujii T, Tanaka H, Maehara K, Nozawa K, Takizawa Y, Ohkawa Y, Kurumizaka H

EMDB-34022:
Cryo-EM structure of human topoisomerase II beta in complex with DNA and etoposide
手法: 単粒子 / : Naganuma M, Ehara H, Kim D, Nakagawa R, Cong A, Bu H, Jeong J, Jang J, Schellenberg MJ, Bunch H, Sekine S

PDB-7yq8:
Cryo-EM structure of human topoisomerase II beta in complex with DNA and etoposide
手法: 単粒子 / : Naganuma M, Ehara H, Kim D, Nakagawa R, Cong A, Bu H, Jeong J, Jang J, Schellenberg MJ, Bunch H, Sekine S

EMDB-36251:
RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1, Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(-1) of the nucleosome
手法: 単粒子 / : Akatsu M, Fujita R, Ogasawara M, Ehara H, Kujirai T, Takizawa Y, Sekine S, Kurumizaka H

EMDB-36252:
RNA polymerase II elongation complex containing 40 bp upstream DNA loop, stalled at SHL(-1) of the nucleosome
手法: 単粒子 / : Akatsu M, Fujita R, Ogasawara M, Ehara H, Kujirai T, Takizawa Y, Sekine S, Kurumizaka H

EMDB-36253:
RNA polymerase II elongation complex containing 60 bp upstream DNA loop, stalled at SHL(-1) of the nucleosome
手法: 単粒子 / : Akatsu M, Fujita R, Ogasawara M, Ehara H, Kujirai T, Takizawa Y, Sekine S, Kurumizaka H

EMDB-37848:
RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1, Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(0) of the nucleosome
手法: 単粒子 / : Akatsu M, Fujita R, Ogasawara M, Ehara H, Kujirai T, Takizawa Y, Sekine S, Kurumizaka H

PDB-8jh2:
RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1, Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(-1) of the nucleosome
手法: 単粒子 / : Akatsu M, Fujita R, Ogasawara M, Ehara H, Kujirai T, Takizawa Y, Sekine S, Kurumizaka H

PDB-8jh3:
RNA polymerase II elongation complex containing 40 bp upstream DNA loop, stalled at SHL(-1) of the nucleosome
手法: 単粒子 / : Akatsu M, Fujita R, Ogasawara M, Ehara H, Kujirai T, Takizawa Y, Sekine S, Kurumizaka H

PDB-8jh4:
RNA polymerase II elongation complex containing 60 bp upstream DNA loop, stalled at SHL(-1) of the nucleosome
手法: 単粒子 / : Akatsu M, Fujita R, Ogasawara M, Ehara H, Kujirai T, Takizawa Y, Sekine S, Kurumizaka H

EMDB-37070:
Cryo-EM structure of the human nucleosome containing H3.8
手法: 単粒子 / : Hirai H, Kujirai T, Takizawa Y, Kurumizaka H

PDB-8kb5:
Cryo-EM structure of the human nucleosome containing H3.8
手法: 単粒子 / : Hirai H, Kujirai T, Takizawa Y, Kurumizaka H

EMDB-36389:
Cryo-EM structure of the human nucleosome with scFv
手法: 単粒子 / : Oishi T, Hatazawa S, Kujirai T, Kato J, Kobayashi Y, Ogasawara M, Akatsu M, Takizawa Y, Kurumizaka H

EMDB-36390:
Cryo-EM structure of the human nucleosome lacking N-terminal region of H2A, H2B, H3, and H4
手法: 単粒子 / : Oishi T, Hatazawa S, Kujirai T, Kato J, Kobayashi Y, Ogasawara M, Akatsu M, Takizawa Y, Kurumizaka H

EMDB-36391:
Cryo-EM structure of the 145 bp human nucleosome containing H3.2 C110A mutant
手法: 単粒子 / : Oishi T, Hatazawa S, Kujirai T, Kato J, Kobayashi Y, Ogasawara M, Akatsu M, Takizawa Y, Kurumizaka H

EMDB-36393:
Cryo-EM structure of the 145 bp human nucleosome containing acetylated H3 tail
手法: 単粒子 / : Oishi T, Hatazawa S, Kujirai T, Kato J, Kobayashi Y, Ogasawara M, Akatsu M, Takizawa Y, Kurumizaka H

PDB-8jl9:
Cryo-EM structure of the human nucleosome with scFv
手法: 単粒子 / : Oishi T, Hatazawa S, Kujirai T, Kato J, Kobayashi Y, Ogasawara M, Akatsu M, Takizawa Y, Kurumizaka H

PDB-8jla:
Cryo-EM structure of the human nucleosome lacking N-terminal region of H2A, H2B, H3, and H4
手法: 単粒子 / : Oishi T, Hatazawa S, Kujirai T, Kato J, Kobayashi Y, Ogasawara M, Akatsu M, Takizawa Y, Kurumizaka H

PDB-8jlb:
Cryo-EM structure of the 145 bp human nucleosome containing H3.2 C110A mutant
手法: 単粒子 / : Oishi T, Hatazawa S, Kujirai T, Kato J, Kobayashi Y, Ogasawara M, Akatsu M, Takizawa Y, Kurumizaka H

PDB-8jld:
Cryo-EM structure of the 145 bp human nucleosome containing acetylated H3 tail
手法: 単粒子 / : Oishi T, Hatazawa S, Kujirai T, Kato J, Kobayashi Y, Ogasawara M, Akatsu M, Takizawa Y, Kurumizaka H

EMDB-36744:
Thermus thermophilus Rho-engaged RNAP elongation complex; EC part
手法: 単粒子 / : Murayama Y, Ehara H, Sekine S

EMDB-36745:
Thermus thermophilus Rho-engaged RNAP elongation complex; Rho part
手法: 単粒子 / : Murayama Y, Ehara H, Sekine S

EMDB-34400:
Cryo-EM structure of the NS5-SLA complex
手法: 単粒子 / : Osawa T, Ehara H, Sekine S

EMDB-34401:
Cryo-EM structure of the NS5-NS3-SLA complex
手法: 単粒子 / : Osawa T, Ehara H, Sekine S

EMDB-34402:
Cryo-EM structure of the the NS5-NS3 RNA-elongation complex
手法: 単粒子 / : Osawa T, Ehara H, Sekine S

PDB-8gzp:
Cryo-EM structure of the NS5-SLA complex
手法: 単粒子 / : Osawa T, Ehara H, Sekine S

PDB-8gzq:
Cryo-EM structure of the NS5-NS3-SLA complex
手法: 単粒子 / : Osawa T, Ehara H, Sekine S

PDB-8gzr:
Cryo-EM structure of the the NS5-NS3 RNA-elongation complex
手法: 単粒子 / : Osawa T, Ehara H, Sekine S

EMDB-32407:
RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-4) of the nucleosome
手法: 単粒子 / : Osumi K, Kujirai T, Ehara H, Sekine S, Takizawa Y, Kurumizaka H

EMDB-32408:
RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-3.5) of the nucleosome
手法: 単粒子 / : Osumi K, Kujirai T, Ehara H, Sekine S, Takizawa Y, Kurumizaka H

EMDB-32409:
RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-3) of the nucleosome
手法: 単粒子 / : Osumi K, Kujirai T, Ehara H, Sekine S, Takizawa Y, Kurumizaka H

EMDB-34685:
RNA polymerase II elongation complex bound with Rad26 and Elf1, stalled at SHL(-3.5) of the nucleosome
手法: 単粒子 / : Osumi K, Kujirai T, Ehara H, Kinoshita C, Saotome M, Kagawa W, Sekine S, Takizawa Y, Kurumizaka H

PDB-7wbv:
RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-4) of the nucleosome
手法: 単粒子 / : Osumi K, Kujirai T, Ehara H, Sekine S, Takizawa Y, Kurumizaka H

PDB-7wbw:
RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-3.5) of the nucleosome
手法: 単粒子 / : Osumi K, Kujirai T, Ehara H, Sekine S, Takizawa Y, Kurumizaka H

PDB-7wbx:
RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-3) of the nucleosome
手法: 単粒子 / : Osumi K, Kujirai T, Ehara H, Sekine S, Takizawa Y, Kurumizaka H

PDB-8he5:
RNA polymerase II elongation complex bound with Rad26 and Elf1, stalled at SHL(-3.5) of the nucleosome
手法: 単粒子 / : Osumi K, Kujirai T, Ehara H, Kinoshita C, Saotome M, Kagawa W, Sekine S, Takizawa Y, Kurumizaka H

EMDB-34588:
Cryo-EM structure of the p300 catalytic core bound to the H4K12acK16ac nucleosome, class 1 (3.2 angstrom resolution)
手法: 単粒子 / : Kikuchi M, Morita S, Wakamori M, Shin S, Uchikubo-Kamo T, Shirouzu M, Umehara T

EMDB-34589:
Cryo-EM structure of the p300 catalytic core bound to the H4K12acK16ac nucleosome, class 2 (3.9 angstrom resolution)
手法: 単粒子 / : Kikuchi M, Morita S, Wakamori M, Shin S, Uchikubo-Kamo T, Shirouzu M, Umehara T

EMDB-34590:
Cryo-EM structure of the p300 catalytic core bound to the H4K12acK16ac nucleosome, class 4 (3.9 angstrom resolution)
手法: 単粒子 / : Kikuchi M, Morita S, Wakamori M, Sato S, Uchikubo-Kamo T, Shirouzu M, Umehara T

EMDB-34591:
Cryo-EM structure of the p300 catalytic core bound to the H4K12acK16ac nucleosome, class 1 (4.7 angstrom resolution)
手法: 単粒子 / : Kikuchi M, Morita S, Wakamori M, Shin S, Uchikubo-Kamo T, Shirouzu M, Umehara T

EMDB-34592:
Cryo-EM structure of the p300 catalytic core bound to the H4K12acK16ac nucleosome, class 2 (4.8 angstrom resolution)
手法: 単粒子 / : Kikuchi M, Morita S, Wakamori M, Shin S, Uchikubo-Kamo T, Shirouzu M, Umehara T

EMDB-34593:
Cryo-EM structure of the p300 catalytic core bound to the H4K12acK16ac nucleosome, class 3
手法: 単粒子 / : Kikuchi M, Morita S, Wakamori M, Sato S, Uchikubo-Kamo T, Shirouzu M, Umehara T

EMDB-34594:
Cryo-EM structure of the p300 catalytic core bound to the H4K12acK16ac nucleosome, class 4 (4.5 angstrom resolution)
手法: 単粒子 / : Kikuchi M, Morita S, Wakamori M, Shin S, Uchikubo-Kamo T, Shirouzu M, Umehara T

EMDB-34595:
Cryo-EM structure of the CBP catalytic core bound to the H4K12acK16ac nucleosome, class 1
手法: 単粒子 / : Kikuchi M, Morita S, Wakamori M, Shin S, Uchikubo-Kamo T, Shirouzu M, Umehara T

EMDB-34596:
Cryo-EM structure of the CBP catalytic core bound to the H4K12acK16ac nucleosome, class 2
手法: 単粒子 / : Kikuchi M, Morita S, Wakamori M, Shin S, Uchikubo-Kamo T, Shirouzu M, Umehara T

EMDB-34597:
Cryo-EM structure of the CBP catalytic core bound to the H4K12acK16ac nucleosome, class 3
手法: 単粒子 / : Kikuchi M, Morita S, Wakamori M, Shin S, Uchikubo-Kamo T, Shirouzu M, Umehara T

PDB-8hag:
Cryo-EM structure of the p300 catalytic core bound to the H4K12acK16ac nucleosome, class 1 (3.2 angstrom resolution)
手法: 単粒子 / : Kikuchi M, Morita S, Wakamori M, Shin S, Uchikubo-Kamo T, Shirouzu M, Umehara T

PDB-8hah:
Cryo-EM structure of the p300 catalytic core bound to the H4K12acK16ac nucleosome, class 2 (3.9 angstrom resolution)
手法: 単粒子 / : Kikuchi M, Morita S, Wakamori M, Shin S, Uchikubo-Kamo T, Shirouzu M, Umehara T

PDB-8hai:
Cryo-EM structure of the p300 catalytic core bound to the H4K12acK16ac nucleosome, class 1 (4.7 angstrom resolution)
手法: 単粒子 / : Kikuchi M, Morita S, Wakamori M, Shin S, Uchikubo-Kamo T, Shirouzu M, Umehara T

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EMN検索について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2021年10月5日: 温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

  • 2021年のノーベル医学・生理学賞は、温度と触覚の受容体を発見したデビッド・ジュリアスとアーデム・パタポウティアンに共同で授与されました
  • EM Navigatorでは、両先駆者によるクライオEM構造データを見つけることができます

外部リンク:The Nobel Prize in Physiology or Medicine 2021 - NobelPrize.org / Structure data by Ardem Patapoutian / Structure data by David Julius

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

テキストデータのダウンロード

EM Navigatorの以下のサービスのデータが、テキスト形式でダウンロードできるようになりました。ダウンロードしたデータをExcelなどで読み込むことができます。

ページデータフォーマット
EM Navigator 検索検索結果CSV, TSV, JSON
EM Navigator 統計情報表データCSV, TSV

関連情報:EMN検索 / EMN統計情報

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豊富な検索条件と表示条件で、EMDBとPDBの電子顕微鏡エントリを検索できます。

関連情報:EMDB / PDB / EM Navigator / Q: EM Navigatorの情報源は？ / 万見検索 / 2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

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