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日本蛋白质结构数据库（PDBj: Protein Data Bank Japan), 由JST-BIRD提供支援，与美国的RCSB, BMRB和欧洲PDBe共同合作，在对国际性的生物大分子立体结构数据库的档案文件进行维护的同时，还提供各种结构解析的应用工具。