ライフサイエンス・データベース講習会 －in 名古屋－
(2010年8月9日(月),10日(火)、名古屋大学・東山キャンパス・情報文化学部棟)
ライフサイエンス統合データベースセンター、DDBJと協力して、ライフサイエンス・データベース講習会を名古屋で開催しました。

8月9日(月)
「ライフサイエンス統合データベースと国のDB施策」 講師：高木 利久 (pdf 3.8M)
「LSDB(生命科学統合データベース）の利用法」 講師：川本 祥子 (pdf 1.2M)
「データベースアーカイブとTogoProtによるデータベース共有と統合化」 講師：畠中 秀樹 (pdf 0.7M)
「DBCLS Galaxy ではじめるゲノムスケールデータの共同研究」 講師：山口 敦子、中尾 光輝 (pdf 1.9M)
「文献執筆支援ツールAllie、inMeXes、TogoDoc」　DBCLS講師陣 (pdf 0.9M)
「DDBJ past and future」 講師：大久保 公策 (pdf 2.1M)
「DDBJの新型シーケンサへの対応 ―　データアーカイブDRAと解析パイプライン」 講師：中村 保一（pdf 6.5M)
「Parsing the Legacy DDBJ-- old but new 」 講師：小笠原 理（pdf 2.2M)

8月10日 (火)
「日本蛋白質構造データバンク（PDBj）とwwPDB」 講師：中村 春木 (pdf 4.2M)
「PDBのデータとその見方・探し方」 講師：金城 玲 (pdf 3.4M)
「EM NavigatorとYorodumiで3次元構造を眺める」 講師：鈴木 博文 (pdf 4.0M)
「配列アラインメントプログラムMAFFTとその構造への拡張 - MAFFTash -」 講師：加藤 和貴 (pdf 2.0M)
「MAFFTash実習」 講師：藤 博幸 (pdf 2.1M)
「eF-site/eF-surf/eF-seekによる蛋白質分子表面の活用」 講師：木下 賢吾 (pdf 14.2M)
「A Functional Annotation Pipeline for Orphan Sequences」 講師：Daron M. Standley (pdf 1.4M)

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PDBj講習会　－in 東京－
(2009年8月7日、東京大学駒場キャンパス)
PDBjを利用者により有効に活用して貰うためパソコンを使用して講習会を開催しました。

「日本蛋白質構造データバンク（PDBj）とその利用について」 講師：中村　春木 (pdf 3.5M)
「PDBのデータとその見方・探し方」 講師：金城　玲 (pdf 2.8M)
「EM NavigatorとYorodumiで3次元構造を眺める」 講師：鈴木　博文 (pdf 14.3M)
「eF-site/eFsurf/sF-seekによる蛋白質の分子表面構造の利用」 講師：木下　賢吾 (pdf 4.0M)
「ProMode/ProMode-Oligomerで蛋白質の揺らぎを観察する」 講師：輪湖 博(pdf 2.4M)
「PDBjにおける構造バイオインフォマティクスのツール」 講師：Daron Standley (pdf 7.3M)

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IUPS 2009 (Tutorial:Bioinformatics for physiology) July 29, 2009

"Finding protein sequence(s) of your interest from public databases." (Kenta Nakai)
"Structural modeling of proteins: Principle and application to an ion channel."
     [lecture / tutorial] (Haruki Nakamura)
"COXPRESdb:gene co-expression database for Human, Mouse, and Rat."
     [Introduction / tutorial] (Kengo Kinoshita)

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DDBJing & KEGGing & PDBjing －講習会 in 京都－
(2008年11月27日～11月28日、京都大学化学研究所)
DDBJ並びにKEGGとの共催により、PDBjを利用者により有効に活用して貰うためパソコンを使用して講習会を開催しました。

「PDBj の紹介」講師：中村　春木 (pdf 1.4M)
「PDBj へのデータ登録方法」講師：松浦　孝範(pdf 1.0M)
「PDBj のデータ検索サービスと二次データベース」講師：金城　玲(pdf 2.3M)

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第8回日本蛋白質科学会年会 ランチョンセミナー　－in 東京－
(2008年6月11日、タワーホール船堀)

「PDBjの活動とサービス」 講師：中村　春木 (pdf 1.8M)
「PDBjへのデータ登録」 講師：松浦　孝範 (pdf 1.1M)
「EM Navigatorの紹介」 講師：鈴木　博文 (pdf 4.6M)
「蛋白質構造百科事典(Wiki-eProtS)の紹介と執筆のお願い」 講師：工藤　高裕 (pdf 4.6M)

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PDBj講習会　－in 大阪－
(2008年3月3日、大阪大学中之島センター・キャンパスイノベーションセンター)
PDBjを利用者により有効に活用して貰うためパソコンを使用して講習会を開催しました。

「日本蛋白質構造データバンク（PDBj）とその利用について」 講師：中村　春木 (pdf 7.0M)
「PDBのデータとその見方・探し方」 講師：金城　玲 (pdf 6.7M)
「EM Navigatorで3次元電子顕微鏡のデータを眺める」 講師：鈴木　博文 (pdf 6.6M)
「PDBjを利用した構造からの機能予測」 講師：木下　賢吾 (pdf 9.0M)
「PDBjにおける構造バイオインフォマティクスのツール： Structural Bioinformatics tools at PDBj」 講師：Standley, M.Daron (pdf 4.2M) (日本語 pdf 0.9M)

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第２回 DDBJing & PDBjing －講習会　in 大阪－
(2006年2月2日～2月3日、大阪大学中之島センター・キャンパスイノベーションセンター)
DDBJとの共催によりPDBjを利用者により有効に活用して貰うためパソコンを使用して講習会を開催しました。

「PDBjの紹介とHPの使い方」　 講師： 中村　春木 (pdf 1.2M)
「PDBjウェブサービスの利用法(xPSSSを中心に)」　 講師：伊藤　暢聡 (pdf 1.4M)
「Development of an Analog Query Service at PDBj」　講師：Daron Standley (pdf 0.9M)
「タンパク質立体構造データベース」　講師：木下　賢吾 (pdf 3.1M)

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第１回 DDBJing & PDBjing －講習会　in 大阪－
(2005年3月2日、大阪大学中之島センター・キャンパスイノベーションセンター)
DDBJとの共催によりPDBjを利用者により有効に活用して貰うためパソコンを使用して講習会を開催しました。

「PDBjの紹介とHPの使い方」　講師：中村　春木 (pdf 3.3M)
「xPSSSによる蛋白質立体構造データの検索法の実習」　講師：中村　春木 (pdf 1.4M)
「ADITによる立体構造データ登録法と実習」　講師：小佐田　高史 (pdf 1.7M)