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日本蛋白質構造データバンク(PDBj: Protein Data Bank Japan)は、米国の構造バイオインフォマティクス研究共同体(RCSB)および欧州バイオインフォマティクス研究所(EBI)と協力し、蛋白質・核酸・糖などの生体高分子の立体構造データベースを国際的なアーカイブとして運営しています。また、派生する様々なデータベースやそれらの解析ツールも提供しています。このPDBjの活動は、独立行政法人科学技術振興機構バイオインフォマティクス推進センター(JST-BIRD)の支援により、大阪大学蛋白質研究所が実施しております。
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