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PDB:1GKA

タンパク質名

クラスタシアニン

生物種

ヨーロピアン・ロブスター(Homarus gammarus)

生物学的役割

赤いロブスターにその色をつけるのはリポカリンと呼ばれるファミリーの蛋白質の一つである。リポカリンはそのβストランドで形成されるバレルの中心に、主に疎水性の化合物を結合させる蛋白質である。本エントリーの蛋白質クルスタシアニンは類似した全体構造をとっているが、いくつかの違いもある。

立体構造の特徴

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第一に、この蛋白質は異なる2つのサブユニットの2量体で構成されている。第二に、アスタキサンチンと呼ばれる疎水性の物質が2個その2量体に結合している。アスタキサンチンは湯がいたロブスターの赤色の元となる物質である。そしてこれら二つの分子は両方のサブユニットに共有されており、それらの間にはもう一つの疎水性物質ドデカン分子がある。 このドデカン分子は2量体のほぼ中心に位置する。 アスタキサンチンはそれらの中央の結合を軸にしての対象性を持っているのに対して、2つの蛋白質単量体はそれぞれ異なっている。それぞれの蛋白質単量体の結合部位はまた異なった構造配置を持っている。アスタキサンチンは実際必ずしも赤色ではなく、その色は化学的環境に依存している。生きているロブスターの殻は赤色でなく青色がかった色である。この色の変化がどのようにして起こるかは長い間良く理解されていなかった。この構造がその効果を説明する助けとなる。

タンパク質構造データバンク(PDB)

参考文献

原論文

  • Cianci, M. Rizkallah, P.J. Olczak, A. Raftery, J. Chayen, N.E. Zagalsky, P.F. Helliwell, J.R.; "The molecular basis of the coloration mechanism in lobster shell: beta-crustacyanin at 3.2-A resolution."; Proc.Natl.Acad.Sci.USA; (2002) 99:9795-9800 PubMed:12119396.

その他

著者:Arno Paehler 訳者:小川 輝


English version:PDB:1GKA