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追加修正箇所

覚え書き

1MSL→2OAR 1UZT→1WCO 1Z2R→deleted

UniProt ID 新規追加

UniProt ID リンク切れによる修正

PubMed ID 新規追加

EC番号関係

  • PDB:1GCB 手動追加（$pdbj_ec_number マクロで追加されなかったもの）
  • PDB:1WBP 番号修正（2.7.1.37→2.7.11.1）
  • PDB:1DFA,PDB:1LWS 番号修正（3.6.1.34→3.6.3.14）
  • PDB:1A0O 番号修正（2.7.3.-→2.7.13.1）
相互リンク追加

  • PDB:1DFA,PDB:1LWS 相互リンク追加（インテインPI-SceIホーミングエンドヌクレアーゼ単独とDNA複合体）。
  • PDB:2BNH,PDB:1DFJ 相互リンク追加（リボヌクレアーゼ阻害蛋白質単体と、リボヌクレアーゼとの複合体）。
  • PDB:1NCI,PDB:1EDH （NカドヘリンとEカドヘリン）相互リンク追加。
  • PDB:1RVA,PDB:1RVA 制限酵素EcoRV（DNA切断前と後）相互リンク追加。
  • PDB:1E79,PDB:1C17 ATP合成酵素（F1部分とF0部分）相互リンク追加。
  • PDB:1OCO,PDB:2OCC チトクロムc酸化酵素（酸化前と酸化後）相互リンク追加。
  • PDB:1Z25,PDB:1U04 どちらもアルゴノートタンパク質。
  • PDB:1IPA,PDB:1MXI どちらもメチル基転移酵素。
  • PDB:1U6B,PDB:1Y0Q どちらもグループI 自己スプライシングイントロンRNA
  • PDB:1FHA,PDB:1H76 鉄輸送タンパク質（フェリチンと血清トランスフェリン）
  • PDB:1H76,PDB:1CX8 トランスフェリンとトランスフェリン受容体
  • PDB:1I1B,PDB:1IBC インターロイキン1βとその変換酵素
  • PDB:1I1B,PDB:1J0S インターロイキン1βとインターロイキン18
  • PDB:1N7D,PDB:1LPE LDL受容体とその結合タンパク質（アポリポタンパク質）
  • PDB:2ZBD,PDB:1VFP カルシウムポンプ（両者とも、xPSSS:1SU4, xPSSS:1IWOへのリンクも追加）。
  • PDB:1YUC,PDB:1XNX 核受容体
  • PDB:1YUC,PDB:2A66 核受容体(hLRH-1)
  • PDB:2GVG,PDB:2GVJ ニコチンアミドホスホリボシル基転移酵素 (NMPRTase) 阻害剤なし/阻害剤との複合体。
その他

  • PDB:1CS6 生物種記述（【xPSSS】CKICKEN→CHICKEN、綴り間違い）。
  • PDB:1LNQ 生物種分類記述（【xPSSS】細菌→古細菌）。
  • PDB:1TYE リガンドや型の異なる同種のタンパク質リンク一覧を追加（６件）。
  • PDB:1ORQ 生物種記述（【xPSSS】マウス・古細菌→古細菌、原論文の記述による）。
  • PDB:1ZWI 生物種記述違い（【旧eProts】【xPSSS】マウス→放線菌、原論文の記述による）。
  • PDB:1DX0 PDB:1QLXへのリンク追加。
  • PDB:1EMA PDB:1BRP（レチノール結合蛋白質）へのリンク追加。
  • PDB:1IWG TolCへのリンク追加（PDBのエントリーがなかったので、xPSSSのエントリーxPSSS:1EK9、xPSSS:1TQQを追加）
  • PDB:1D7P xPSSS:1CFG（前駆体ではないもの）へのリンク追加。
  • PDB:1MXI 「リガンドなしの構造」という記述になっていたが、PDB(XMLの<PDBx:entityCategory>の比較)や原論文の内容を調べた結果、この構造はリガンドとの複合体を示したものであることが判明、記述修正。リガンドなしはxPSSS:1J85（eProtsでは未登録）、リンク追加。
  • PDB:1SG1 xPSSS:1NGR（リガンドp75）,xPSSS:1WWW（リガンドTrkとの複合体）へのリンク追加。
  • PDB:1Z25 xPSSS:1Z26へのリンク追加（同じタンパク質で、リガンドが異なる。1Z25はMg2+、1Z26はW（タングステン））。
  • PDB:1KF1 xPSSS:1K8Pへのリンク追加（1KF1→１本鎖22塩基、1K8P→２本鎖各12塩基、どちらもヒト・テロメアDNA）
  • PDB:2BGG xPSSS:1YTU,xPSSS:1W9H（同じタンパク質でリガンド違い）へのリンク追加。
    2BGG→Mn,RNA-like x2　1YTU→Mg,RNA-like x2　1W9H→Cd,Ni,Cl
  • PDB:2BA0 xPSSS:2BA1（他のRNA結合タンパク質、同じエンドヌクレアーゼ）へのリンク追加。
内容修正必要

  • PDB:1SFO 内容がタイトルと異なる。
    内容：アクアポリン０
    タイトル：RNAポリメラーゼII／転写複合体
    ※原論文、UniProtなど他の情報はRNAポリメラーゼに関するものなので、内容が間違っていると思われる。 →修正済み
  • PDB:1CX8 「立体構造の特徴」に、構造に関する具体的記述がない。
  • PDB:2GXA 内容補足、英語版作成必要→済