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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 8iwj | ||||||
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タイトル | ABCG25 Wild Type in Apo-state | ||||||
要素 | ABC transporter G family member 25 | ||||||
キーワード | TRANSPORT PROTEIN (運搬体タンパク質) / ABA / ABCG / plant hormone (植物ホルモン) | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 negative regulation of post-embryonic development / abscisic acid transport / export from cell / intercellular transport / response to abscisic acid / abscisic acid-activated signaling pathway / efflux transmembrane transporter activity / ATPase-coupled transmembrane transporter activity / ABC-type transporter activity / response to cold ...negative regulation of post-embryonic development / abscisic acid transport / export from cell / intercellular transport / response to abscisic acid / abscisic acid-activated signaling pathway / efflux transmembrane transporter activity / ATPase-coupled transmembrane transporter activity / ABC-type transporter activity / response to cold / transmembrane transport / response to heat / ATP hydrolysis activity / ATP binding / 細胞膜 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ) | ||||||
手法 | 電子顕微鏡法 / 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3 Å | ||||||
データ登録者 | Sun, L. / Liu, X. / Ying, W. / Liao, L. / Wei, H. | ||||||
資金援助 | 中国, 1件
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引用 | ジャーナル: To Be Published タイトル: ABCG25 Wild Type in Apo-state 著者: Sun, L. / Liu, X. / Ying, W. / Liao, L. / Wei, H. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 8iwj.cif.gz | 193.1 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb8iwj.ent.gz | 154.9 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 8iwj.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/iw/8iwj ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/iw/8iwj | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
関連構造データ | 35768MC M: このデータのモデリングに利用したマップデータ C: 同じ文献を引用 (文献) |
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類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索 |
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 72983.867 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ) 遺伝子: ABCG25 発現宿主: Spodoptera frugiperda (ツマジロクサヨトウ) 参照: UniProt: Q84TH5 |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 電子顕微鏡法 |
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EM実験 | 試料の集合状態: PARTICLE / 3次元再構成法: 単粒子再構成法 |
-試料調製
構成要素 | 名称: ABCG25 from Arabidopsis thaliana / タイプ: ORGANELLE OR CELLULAR COMPONENT / Entity ID: all / 由来: RECOMBINANT |
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分子量 | 実験値: NO |
由来(天然) | 生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ) |
由来(組換発現) | 生物種: Spodoptera frugiperda (ツマジロクサヨトウ) |
緩衝液 | pH: 7.4 |
試料 | 包埋: NO / シャドウイング: NO / 染色: NO / 凍結: YES |
急速凍結 | 凍結剤: ETHANE |
-電子顕微鏡撮影
実験機器 | モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |
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顕微鏡 | モデル: FEI TITAN KRIOS |
電子銃 | 電子線源: FIELD EMISSION GUN / 加速電圧: 300 kV / 照射モード: FLOOD BEAM |
電子レンズ | モード: DIFFRACTION回折 / 最大 デフォーカス(公称値): 2300 nm / 最小 デフォーカス(公称値): 1500 nm |
撮影 | 電子線照射量: 50 e/Å2 フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 BIOQUANTUM (6k x 4k) |
-解析
CTF補正 | タイプ: NONE |
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3次元再構成 | 解像度: 3 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 粒子像の数: 174479 / 対称性のタイプ: POINT |