+Open data
-Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 7b69 | ||||||
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Title | BK Polyomavirus VP1 pentamer core(residues 26-299) mutant C104S | ||||||
Components | Major capsid protein VP1 | ||||||
Keywords | VIRAL PROTEIN / Polyomavirus / Capsid protein | ||||||
Function / homology | Function and homology information caveolin-mediated endocytosis of virus by host cell / T=7 icosahedral viral capsid / host cell nucleus / virion attachment to host cell / structural molecule activity Similarity search - Function | ||||||
Biological species | BK polyomavirus | ||||||
Method | X-RAY DIFFRACTION / SYNCHROTRON / MOLECULAR REPLACEMENT / Resolution: 1.474 Å | ||||||
Authors | Osipov, E.M. / Beelen, S. / Strelkov, S.V. | ||||||
Funding support | Belgium, 1items
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Citation | Journal: Rsc Chem Biol / Year: 2022 Title: Discovery of novel druggable pockets on polyomavirus VP1 through crystallographic fragment-based screening to develop capsid assembly inhibitors. Authors: Osipov, E.M. / Munawar, A.H. / Beelen, S. / Fearon, D. / Douangamath, A. / Wild, C. / Weeks, S.D. / Van Aerschot, A. / von Delft, F. / Strelkov, S.V. | ||||||
History |
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-Structure visualization
Structure viewer | Molecule: MolmilJmol/JSmol |
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-Downloads & links
-Download
PDBx/mmCIF format | 7b69.cif.gz | 575.6 KB | Display | PDBx/mmCIF format |
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PDB format | pdb7b69.ent.gz | Display | PDB format | |
PDBx/mmJSON format | 7b69.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
Others | Other downloads |
-Validation report
Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/b6/7b69 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/b6/7b69 | HTTPS FTP |
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-Related structure data
Related structure data | 7b6aC 7b6cC 4mj0S S: Starting model for refinement C: citing same article (ref.) |
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Similar structure data | Similarity search - Function & homologyF&H Search |
-Links
-Assembly
Deposited unit |
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Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
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