PDB-4wdy: JC Polyomavirus VP1 five-fold pore mutant N221Q

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 4wdy

タイトル

JC Polyomavirus VP1 five-fold pore mutant N221Q

要素

Major capsid protein VP1

キーワード

VIRAL PROTEIN (ウイルスタンパク質) /

beta-sandwich / jelly-roll / viral major capsid protein / five-fold pore

機能・相同性

機能・相同性情報

T=7 icosahedral viral capsid / clathrin-dependent endocytosis of virus by host cell / host cell nucleus / virion attachment to host cell / structural molecule activity
類似検索 - 分子機能

生物種

JC polyomavirus (JC ポリオーマウイルス)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 1.9 Å

データ登録者

Stroh, L.J. / Stehle, T.

引用

ジャーナル: J.Virol. / 年: 2015
タイトル: Modulation of a Pore in the Capsid of JC Polyomavirus Reduces Infectivity and Prevents Exposure of the Minor Capsid Proteins.
著者: Nelson, C.D. / Stroh, L.J. / Gee, G.V. / O'Hara, B.A. / Stehle, T. / Atwood, W.J.

履歴

登録	2014年9月9日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: PDBE
改定 1.0	2015年2月18日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2015年3月18日	Group: Database references
改定 1.2	2024年1月10日	Group: Data collection / Database references / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_ncs_dom_lim Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_seq_id / _struct_ncs_dom_lim.end_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_seq_id

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

-
ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	4wdy.cif.gz	511.2 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb4wdy.ent.gz	423.1 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	4wdy.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

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検証レポート

アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/wd/4wdy ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/wd/4wdy	HTTPS FTP

-
関連構造データ

関連構造データ	4wdzC 4we0C 3nxgS 3nxd S: 精密化の開始モデル C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	4jce-d 3nxg-d 4x0y-d 4x11-d 4wdz-d 4x16-d 4x0z-d 4jcd-d 4mj1-d 4x14-d Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#47 - 2003年11月シミアンウイルス40 (Simian Virus 40) 類似性 (4) #221 - 2018年5月ヒトパピローマウイルスとワクチン (Human Papillomavirus and Vaccines) 類似性 (1) #200 - 2016年8月正二十面体型ウイルスの準対称性 (Quasisymmetry in Icosahedral Viruses) 類似性 (5)

登録構造単位

A: Major capsid protein VP1

B: Major capsid protein VP1

C: Major capsid protein VP1

D: Major capsid protein VP1

E: Major capsid protein VP1

ヘテロ分子

151 kDa, 5 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

登録構造と同一
登録者・ソフトウェアが定義した集合体

単位格子

Length a, b, c (Å)	149.710, 95.790, 128.510
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 110.38, 90.00
Int Tables number	5
Space group name H-M	C121

非結晶学的対称性 (NCS)

NCSドメイン:

ID	Ens-ID	詳細
1	1	A
2	1	B
3	1	C
4	1	D
5	1	E

NCSドメイン領域:

Ens-ID: 1 / Refine code: 4

Dom-ID	Component-ID	Beg auth comp-ID	Beg label comp-ID	End auth comp-ID	End label comp-ID	Auth asym-ID	Label asym-ID	Auth seq-ID	Label seq-ID
1	1	VAL	VAL	VAL	VAL	A	A	26 - 29	9 - 12
2	1	VAL	VAL	VAL	VAL	B	B	26 - 29	9 - 12
3	1	VAL	VAL	VAL	VAL	C	C	26 - 29	9 - 12
4	1	VAL	VAL	VAL	VAL	D	D	26 - 29	9 - 12
5	1	VAL	VAL	VAL	VAL	E	E	26 - 29	9 - 12
1	2	THR	THR	ASP	ASP	A	A	31 - 51	14 - 34
2	2	THR	THR	ASP	ASP	B	B	31 - 51	14 - 34
3	2	THR	THR	ASP	ASP	C	C	31 - 51	14 - 34
4	2	THR	THR	ASP	ASP	D	D	31 - 51	14 - 34
5	2	THR	THR	ASP	ASP	E	E	31 - 51	14 - 34
1	3	HIS	HIS	PHE	PHE	A	A	53 - 57	36 - 40
2	3	HIS	HIS	PHE	PHE	B	B	53 - 57	36 - 40
3	3	HIS	HIS	PHE	PHE	C	C	53 - 57	36 - 40
4	3	HIS	HIS	PHE	PHE	D	D	53 - 57	36 - 40
5	3	HIS	HIS	PHE	PHE	E	E	53 - 57	36 - 40
1	4	PRO	PRO	ILE	ILE	A	A	78 - 85	61 - 68
2	4	PRO	PRO	ILE	ILE	B	B	78 - 85	61 - 68
3	4	PRO	PRO	ILE	ILE	C	C	78 - 85	61 - 68
4	4	PRO	PRO	ILE	ILE	D	D	78 - 85	61 - 68
5	4	PRO	PRO	ILE	ILE	E	E	78 - 85	61 - 68
1	5	MET	MET	VAL	VAL	A	A	101 - 111	84 - 94
2	5	MET	MET	VAL	VAL	B	B	101 - 111	84 - 94
3	5	MET	MET	VAL	VAL	C	C	101 - 111	84 - 94
4	5	MET	MET	VAL	VAL	D	D	101 - 111	84 - 94
5	5	MET	MET	VAL	VAL	E	E	101 - 111	84 - 94
1	6	ALA	ALA	THR	THR	A	A	126 - 162	109 - 145
2	6	ALA	ALA	THR	THR	B	B	126 - 162	109 - 145
3	6	ALA	ALA	THR	THR	C	C	126 - 162	109 - 145
4	6	ALA	ALA	THR	THR	D	D	126 - 162	109 - 145
5	6	ALA	ALA	THR	THR	E	E	126 - 162	109 - 145
1	7	ASN	ASN	LEU	LEU	A	A	173 - 189	156 - 172
2	7	ASN	ASN	LEU	LEU	B	B	173 - 189	156 - 172
3	7	ASN	ASN	LEU	LEU	C	C	173 - 189	156 - 172
4	7	ASN	ASN	LEU	LEU	D	D	173 - 189	156 - 172
5	7	ASN	ASN	LEU	LEU	E	E	173 - 189	156 - 172
1	8	ALA	ALA	THR	THR	A	A	194 - 205	177 - 188
2	8	ALA	ALA	THR	THR	B	B	194 - 205	177 - 188
3	8	ALA	ALA	THR	THR	C	C	194 - 205	177 - 188
4	8	ALA	ALA	THR	THR	D	D	194 - 205	177 - 188
5	8	ALA	ALA	THR	THR	E	E	194 - 205	177 - 188
1	9	PHE	PHE	VAL	VAL	A	A	240 - 287	223 - 270
2	9	PHE	PHE	VAL	VAL	B	B	240 - 287	223 - 270
3	9	PHE	PHE	VAL	VAL	C	C	240 - 287	223 - 270
4	9	PHE	PHE	VAL	VAL	D	D	240 - 287	223 - 270
5	9	PHE	PHE	VAL	VAL	E	E	240 - 287	223 - 270
1	10	ILE	ILE	SER	SER	A	A	112 - 122	95 - 105
2	10	ILE	ILE	SER	SER	B	B	112 - 122	95 - 105
3	10	ILE	ILE	SER	SER	C	C	112 - 122	95 - 105
4	10	ILE	ILE	SER	SER	D	D	112 - 122	95 - 105
5	10	ILE	ILE	SER	SER	E	E	112 - 122	95 - 105

NCS oper:

ID	Code	Matrix	ベクター
1	given	(1), (1), (1)
2	given	(0.44078, 0.853573, 0.277716), (-0.856622, 0.30758, 0.414237), (0.268161, -0.420485, 0.866765)	11.5878, 20.15611, -5.78389
3	given	(-0.449023, 0.513278, 0.731385), (-0.52777, -0.812853, 0.246434), (0.720998, -0.275348, 0.635882)	31.77968, 14.10822, -15.77693
4	given	(-0.441147, -0.53469, 0.72076), (0.519328, -0.807097, -0.280879), (0.731906, 0.250402, 0.633728)	32.80217, -9.30723, -16.69683
5	given	(0.448894, -0.8519, 0.269741), (0.848029, 0.310984, -0.42911), (0.281674, 0.421373, 0.862035)	13.28813, -18.20094, -6.79227

#1: タンパク質	Major capsid protein VP1 / / Major structural protein VP1 / Mad-1 分子量: 30089.889 Da / 分子数: 5 / 断片: UNP Residues 23-290 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) JC polyomavirus (JC ポリオーマウイルス) プラスミド: plasmid / 詳細 (発現宿主): pET15b / 発現宿主: Escherichia coli BL21(DE3) (大腸菌) / 参照: UniProt: P03089
#2: 化合物	ChemComp-GOL / GLYCEROL / GLYCERIN / PROPANE-1,2,3-TRIOL / グリセロ-ル / グリセリン分子量: 92.094 Da / 分子数: 5 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₃H₈O₃
#3: 化合物	ChemComp-EDO / 1,2-ETHANEDIOL / ETHYLENE GLYCOL / エチレングリコ-ル / エチレングリコール分子量: 62.068 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₂H₆O₂
#4: 水	ChemComp-HOH / water / 水分子量: 18.015 Da / 分子数: 724 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
実験

実験	手法: X線回折

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.87 Å³/Da / 溶媒含有率: 57.15 %
結晶化	温度: 293 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 7.5 / 詳細: 0.1 M HEPES pH 7.5, 0.2 M KSCN, 12% PEG 3350

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: SLS / ビームライン: X06DA / 波長: 1 Å
検出器	タイプ: MARMOSAIC 225 mm CCD / 検出器: CCD / 日付: 2010年8月18日
放射	モノクロメーター: Bartels Monochromator / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 1 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 1.9→50 Å / Num. obs: 131987 / % possible obs: 98.1 % / 冗長度: 4.1 % / B_iso Wilson estimate: 31.9 Å² / Net I/σ(I): 9.4
反射シェル	解像度: 1.9→1.95 Å / Mean I/σ(I) obs: 1.7 / % possible all: 83.5

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
REFMAC	5.8.0049	精密化
XDS		データ削減
Coot		モデル構築
XSCALE		データスケーリング
PHASER		位相決定

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: 3NXG

3nxg

解像度: 1.9→50 Å / Cor.coef. F_o:F_c: 0.956 / Cor.coef. F_o:F_c free: 0.94 / SU B: 7.856 / SU ML: 0.11 / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R: 0.137 / ESU R Free: 0.132 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS

	R_factor	反射数	%反射	Selection details
R_free	0.22917	6536	5 %	RANDOM
R_work	0.19076	-	-	-
obs	0.19271	123517	97.13 %	-

溶媒の処理

イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: MASK

原子変位パラメータ

B_iso mean: 31.057 Å²

	B_aniso -1	B_aniso -2	B_aniso -3
1-	0.38 Å²	0 Å²	0.39 Å²
2-	-	-0.71 Å²	-0 Å²
3-	-	-	0.03 Å²

精密化ステップ

サイクル: 1 / 解像度: 1.9→50 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	10012	0	46	724	10782

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	Dev ideal target	数
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_refined_d	0.008	0.019	10332
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_other_d	0.001	0.02	9618
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_refined_deg	1.315	1.956	14038
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_other_deg	0.748	3	22160
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_1_deg	6.426	5	1299
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_2_deg	34.989	24.277	470
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_3_deg	12.728	15	1675
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_4_deg	17.419	15	62
X-RAY DIFFRACTION	r_chiral_restr	0.079	0.2	1576
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_refined	0.005	0.021	11781
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_other	0.001	0.02	2377
X-RAY DIFFRACTION	r_nbd_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_nbd_other
X-RAY DIFFRACTION	r_nbtor_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_nbtor_other
X-RAY DIFFRACTION	r_xyhbond_nbd_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_xyhbond_nbd_other
X-RAY DIFFRACTION	r_metal_ion_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_metal_ion_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_vdw_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_vdw_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_hbond_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_hbond_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_metal_ion_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_metal_ion_other
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_it	2.467	6.243	5172
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_other	2.466	6.242	5171
X-RAY DIFFRACTION	r_mcangle_it	2.929	8.386	6452
X-RAY DIFFRACTION	r_mcangle_other	2.93	8.387	6453
X-RAY DIFFRACTION	r_scbond_it	3.812	7.322	5160
X-RAY DIFFRACTION	r_scbond_other	3.81	7.322	5160
X-RAY DIFFRACTION	r_scangle_it
X-RAY DIFFRACTION	r_scangle_other	5.008	9.489	7578
X-RAY DIFFRACTION	r_long_range_B_refined	6.661	17.115	11703
X-RAY DIFFRACTION	r_long_range_B_other	6.661	17.118	11704
X-RAY DIFFRACTION	r_rigid_bond_restr
X-RAY DIFFRACTION	r_sphericity_free
X-RAY DIFFRACTION	r_sphericity_bonded

Refine LS restraints NCS

Dom-ID: 1 / Ens-ID: 1 / 数: 2619 / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

Auth asym-ID	タイプ	Rms dev position (Å)	Weight position
A	medium positional	0.24	0.5
B	medium positional	0.29	0.5
C	medium positional	0.26	0.5
D	medium positional	0.24	0.5
E	medium positional	0.22	0.5
A	medium thermal	1.95	2
B	medium thermal	1.76	2
C	medium thermal	1.84	2
D	medium thermal	1.72	2
E	medium thermal	1.7	2

LS精密化シェル

解像度: 1.9→1.949 Å / Num. reflection R_free: 326 / Num. reflection R_work: 6513

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	0.8024	-0.0091	0.5949	0.7743	-0.281	1.6275	-0.1149	0.042	0.0593	0.0856	0.0392	-0.0929	-0.1747	0.2513	0.0756	0.0423	0.0128	-0.0294	0.1475	0.0147	0.1139	60.3216	11.6743	18.5709
2	0.4538	-0.2246	0.1186	0.7045	0.0765	0.6065	-0.0196	0.044	-0.0109	0.0014	-0.0093	-0.0337	-0.0094	0.0539	0.0289	0.0236	-0.0217	-0.0377	0.1136	0.0235	0.0727	57.9486	5.346	18.5124
3	4.8994	0.17	4.6386	0.5822	0.3166	5.8795	-0.1535	0.0046	0.1414	0.0703	-0.0443	-0.0544	-0.1477	0.1194	0.1977	0.0253	-0.0212	-0.0099	0.051	0.0239	0.0538	58.9104	12.0185	23.9885
4	8.561	0.115	3.7309	1.5796	-0.3965	2.8519	0.0064	-0.3201	-0.1287	0.1062	0.0149	-0.0608	-0.2422	-0.0715	-0.0213	0.2608	-0.003	-0.0301	0.2268	-0.019	0.1982	44.4985	30.2207	52.0871
5	0.8948	0.0462	-0.0852	0.1817	-0.2205	0.7606	-0.0311	-0.0115	0.0889	0.0176	0.0134	0.0113	-0.1345	-0.0415	0.0177	0.0612	0.0106	-0.0533	0.0831	0.0009	0.1051	37.9547	25.0359	25.2184
6	2.4584	0.931	2.616	1.1313	1.1132	4.5704	-0.0336	-0.0956	0.0242	0.0673	-0.0065	-0.0568	-0.11	0.0628	0.0401	0.046	0.0265	-0.0105	0.081	0.0117	0.0717	38.5788	25.7316	35.6832
7	4.3573	2.4627	3.655	3.1474	2.2833	6.9479	0.2151	-0.0818	-0.1733	0.5154	0.0131	-0.0704	0.3085	-0.0083	-0.2282	0.1701	0.0348	-0.0298	0.2151	-0.0119	0.146	21.8362	5.5234	63.0153
8	0.4229	-0.025	0.23	0.976	-0.0322	0.4809	-0.005	-0.0331	0.0416	0.0186	0.0101	0.0591	-0.0423	-0.1049	-0.0051	0.0188	0.015	-0.0292	0.1376	0.0008	0.087	15.5393	11.0154	35.6934
9	1.215	0.2105	1.4545	0.8834	0.922	5.449	0.0169	-0.0926	0.0392	0.1109	0.0015	-0.0519	-0.0685	0.0225	-0.0185	0.0275	0.0024	-0.0187	0.081	0.0236	0.1027	19.4384	6.8557	46.0681
10	0.4902	-0.4596	1.0008	2.4846	3.3024	12.363	-0.0389	-0.0522	-0.079	0.1532	0.0216	-0.0366	0.1634	0.2875	0.0174	0.1276	-0.0426	-0.0098	0.2358	0.0543	0.1926	35.2234	-24.8561	55.9389
11	0.8569	-0.0874	-0.1395	0.3815	0.2262	0.7049	0.0066	-0.0131	-0.0252	-0.0001	0.014	0.0532	0.0715	-0.0633	-0.0206	0.0277	-0.0154	-0.044	0.096	0.0055	0.0904	21.011	-16.8357	33.3221
12	0.98	-0.2056	1.0513	0.7709	-0.569	6.0697	-0.0327	-0.1432	-0.0156	0.0962	0.053	0.0368	-0.0985	-0.0229	-0.0202	0.0244	-0.0004	-0.0271	0.0809	-0.0013	0.0955	28.1834	-19.7098	41.3185
13	1.8495	0.1328	0.5283	0.8755	-1.4777	10.1513	-0.0474	-0.1081	-0.0487	0.2113	-0.0454	-0.1883	-0.2716	0.3768	0.0928	0.1408	0.0467	-0.0178	0.1433	-0.0223	0.1708	65.1853	-20.6591	41.5457
14	0.5444	0.2372	0.1321	0.3768	-0.0827	0.7337	0.0166	0.0454	-0.0491	-0.0509	-0.007	0.0061	0.0575	0.051	-0.0096	0.0237	0.014	-0.0353	0.0903	-0.0148	0.0905	46.1784	-20.0166	20.8973
15	1.8696	-0.7464	2.2374	1.1453	-1.3036	4.3903	-0.0457	-0.0337	0.0161	0.0586	-0.0302	-0.011	-0.0189	0.0283	0.0759	0.0087	-0.0027	-0.0119	0.0643	-0.0254	0.076	53.6794	-17.9231	27.1634

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	A	24 - 68
2	X-RAY DIFFRACTION	2	A	69 - 263
3	X-RAY DIFFRACTION	3	A	264 - 288
4	X-RAY DIFFRACTION	4	B	24 - 42
5	X-RAY DIFFRACTION	5	B	43 - 237
6	X-RAY DIFFRACTION	6	B	238 - 288
7	X-RAY DIFFRACTION	7	C	25 - 42
8	X-RAY DIFFRACTION	8	C	43 - 232
9	X-RAY DIFFRACTION	9	C	233 - 289
10	X-RAY DIFFRACTION	10	D	24 - 42
11	X-RAY DIFFRACTION	11	D	43 - 236
12	X-RAY DIFFRACTION	12	D	237 - 289
13	X-RAY DIFFRACTION	13	E	24 - 42
14	X-RAY DIFFRACTION	14	E	43 - 238
15	X-RAY DIFFRACTION	15	E	239 - 288

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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