登録情報 データベース : PDB / ID : 3af6 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル The crystal structure of an archaeal CPSF subunit, PH1404 from Pyrococcus horikoshii complexed with RNA-analog 要素5'-R(*(SSU)P*(SSU)P*(SSU)P*(SSU)P*(SSU)P*(SSU))-3'Putative uncharacterized protein PH1404 詳細キーワード HYDROLASE/RNA / archaeal CPSF / beta-CASP family / KH domain (KHドメイン) / ribonuclease (リボヌクレアーゼ) / metallo-beta-lactamase superfamily / Pyrococcus horikoshii / archaea (古細菌) / RNA-analog / HYDROLASE-RNA complex機能・相同性 機能・相同性情報分子機能 ドメイン・相同性 構成要素
GMP Synthetase; Chain A, domain 3 - #230 / Transcription termination factor CPSF1, archaea / KH domain, archaeal / KHドメイン / Rossmann fold - #10890 / Metallo-beta-lactamase superfamily domain / Beta-Casp domain / Beta-Casp domain / Beta-Casp domain / Zn-dependent metallo-hydrolase, RNA specificity domain ... GMP Synthetase; Chain A, domain 3 - #230 / Transcription termination factor CPSF1, archaea / KH domain, archaeal / KHドメイン / Rossmann fold - #10890 / Metallo-beta-lactamase superfamily domain / Beta-Casp domain / Beta-Casp domain / Beta-Casp domain / Zn-dependent metallo-hydrolase, RNA specificity domain / Zn-dependent metallo-hydrolase RNA specificity domain / K homology (KH) domain / GMP Synthetase; Chain A, domain 3 / Metallo-beta-lactamase superfamily / Metallo-beta-lactamase / Ribonuclease Z/Hydroxyacylglutathione hydrolase-like / Metallo-beta-lactamase; Chain A / Ribonuclease Z/Hydroxyacylglutathione hydrolase-like / KHドメイン / K homology RNA-binding domain / K homology domain superfamily, prokaryotic type / 4-Layer Sandwich / K homology domain-like, alpha/beta / ロスマンフォールド / 2-Layer Sandwich / 3-Layer(aba) Sandwich / Alpha Beta 類似検索 - ドメイン・相同性生物種 Pyrococcus horikoshii (古細菌)手法 X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度 : 2.6 Å 詳細データ登録者 Nishida, Y. / Ishikawa, H. / Nakagawa, N. / Masui, R. / Kuramitsu, S. 引用ジャーナル : Proteins / 年 : 2010タイトル : Crystal structure of an archaeal cleavage and polyadenylation specificity factor subunit from Pyrococcus horikoshii著者 : Nishida, Y. / Ishikawa, H. / Baba, S. / Nakagawa, N. / Kuramitsu, S. / Masui, R. 履歴 登録 2010年2月24日 登録サイト : PDBJ / 処理サイト : PDBJ改定 1.0 2010年4月21日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.1 2011年7月13日 Group : Version format compliance改定 1.2 2023年11月1日 Group : Advisory / Data collection ... Advisory / Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ : chem_comp_atom / chem_comp_bond ... chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_conn_angle / pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms / struct_conn / struct_site Item : _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ... _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id
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