温度: 277 K / 手法: 蒸気拡散法 / pH: 6.5 詳細: Na cacodyrate, Mg(NO3)2, PEG 4000, GlcNAc, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K
-
データ収集
回折
ID
平均測定温度 (K)
Crystal-ID
1
95
1
2
100
1
放射光源
由来
サイト
ビームライン
ID
波長 (Å)
シンクロトロン
Photon Factory
AR-NW12A
1
1
シンクロトロン
Photon Factory
BL-5A
2
0.97934, 0.97974, 0.96450
検出器
タイプ
ID
検出器
日付
ADSC QUANTUM 210
1
CCD
2007年6月4日
ADSC QUANTUM 315
2
CCD
2006年11月29日
放射
ID
プロトコル
単色(M)・ラウエ(L)
散乱光タイプ
Wavelength-ID
1
SINGLEWAVELENGTH
M
x-ray
1
2
MAD
M
x-ray
2
放射波長
ID
波長 (Å)
相対比
1
1
1
2
0.97934
1
3
0.97974
1
4
0.9645
1
反射
解像度: 1.85→50 Å / Num. obs: 126352 / % possible obs: 98.5 % / 冗長度: 3.8 % / Biso Wilson estimate: 19.7 Å2 / Rmerge(I) obs: 0.068 / Χ2: 1.025 / Net I/σ(I): 21.811
反射 シェル
解像度: 1.85→1.92 Å / 冗長度: 3.9 % / Rmerge(I) obs: 0.25 / Mean I/σ(I) obs: 2.7 / Num. unique all: 12453 / Χ2: 0.436 / % possible all: 97.7
-
解析
ソフトウェア
名称
バージョン
分類
NB
DENZO
データ削減
SCALEPACK
データスケーリング
REFMAC
精密化
PDB_EXTRACT
3.006
データ抽出
HKL-2000
データ削減
HKL-2000
データスケーリング
MOLREP
位相決定
精密化
構造決定の手法: 分子置換 開始モデル: Identical protein belonging to different space group 解像度: 1.85→35.14 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.967 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.946 / WRfactor Rfree: 0.183 / WRfactor Rwork: 0.143 / Occupancy max: 1 / Occupancy min: 0 / FOM work R set: 0.897 / SU R Cruickshank DPI: 0.129 / SU Rfree: 0.123 / Isotropic thermal model: Isotropic / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 0 / ESU R: 0.129 / ESU R Free: 0.123 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS U VALUES: REFINED INDIVIDUALLY
Rfactor
反射数
%反射
Selection details
Rfree
0.192
6359
5 %
RANDOM
Rwork
0.149
-
-
-
obs
0.151
126337
98.37 %
-
溶媒の処理
イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.4 Å / 溶媒モデル: MASK