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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1etu | ||||||
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タイトル | STRUCTURAL DETAILS OF THE BINDING OF GUANOSINE DIPHOSPHATE TO ELONGATION FACTOR TU FROM E. COLI AS STUDIED BY X-RAY CRYSTALLOGRAPHY | ||||||
要素 | ELONGATION FACTOR TUEF-Tu | ||||||
キーワード | TRANSPORT AND PROTECTION PROTEIN | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 guanyl-nucleotide exchange factor complex / translational elongation / guanosine tetraphosphate binding / translation elongation factor activity / response to antibiotic / GTPase activity / GTP binding / RNA binding / 細胞膜 / 細胞質 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Escherichia coli (大腸菌) | ||||||
手法 | X線回折 / 解像度: 2.9 Å | ||||||
データ登録者 | Clark, B.F.C. / Lacour, T.F.M. / Kjeldgaard, M. / Morikawa, K. / Nyborg, J. / Rubin, R. / Thirup, S. | ||||||
引用 | ジャーナル: EMBO J. / 年: 1985 タイトル: Structural details of the binding of guanosine diphosphate to elongation factor Tu from E. coli as studied by X-ray crystallography. 著者: la Cour, T.F. / Nyborg, J. / Thirup, S. / Clark, B.F. #1: ジャーナル: Science / 年: 1985 タイトル: A Model for the Tertiary Structure of P21, the Product of the Ras Oncogene 著者: Mccormick, F. / Clark, B.F.C. / Lacour, T.F.M. / Kjeldgaard, M. / Norskov-Lauritsen, L. / Nyborg, J. #2: ジャーナル: Gene Expression. The Translational Step and its Control 年: 1984 タイトル: Structure of Bacterial Elongation Factor EF-TU and its Interaction with Aminoacyl-tRNA 著者: Clark, B.F.C. / Lacour, T.F.M. / Nielsen, K.M. / Nyborg, J. / Petersen, H.U. / Siboska, G.E. / Wikman, F.P. #3: ジャーナル: FEBS Lett. / 年: 1981 タイトル: Structural Features of the Gdp Binding Site of Elongation Factor TU from Escherichia Coli as Determined by X-Ray Diffraction 著者: Rubin, J.R. / Morikawa, K. / Nyborg, J. / Lacour, T.F.M. / Clark, B.F.C. / Miller, D.L. #4: ジャーナル: J.Mol.Biol. / 年: 1978 タイトル: High Resolution X-Ray Crystallographic Analysis of a Modified Form of the Elongation Factor TU(Colon) Guanosine Diphosphate Complex 著者: Morikawa, K. / Lacour, T.F.M. / Nyborg, J. / Rasmussen, K.M. / Miller, D.L. / Clark, B.F.C. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1etu.cif.gz | 47.2 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1etu.ent.gz | 34.1 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1etu.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/et/1etu ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/et/1etu | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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単位格子 |
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Atom site foot note | 1: SEE REMARK 5. |
-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 43209.270 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Escherichia coli (大腸菌) / 株: K12 / 参照: UniProt: P0A6N1, UniProt: P0CE47*PLUS |
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#2: 化合物 | ChemComp-MG / |
#3: 化合物 | ChemComp-GDP / |
配列の詳細 | EF-TU IS CODED FOR BY TWO DIFFERENT GENES. THE SEQUENCE STRUCTURE ANALYSIS CARRIED OUT ON THIS ...EF-TU IS CODED FOR BY TWO DIFFERENT GENES. THE SEQUENCE STRUCTURE ANALYSIS CARRIED OUT ON THIS MIXTURE SHOWS THAT THE C-TERMINAL RESIDUE OCCURS AS GLY/SER IN THE RATIO OF 3/1. THIS RESIDUE IS IDENTIFIED |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: X線回折 |
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-試料調製
結晶 | マシュー密度: 4.6 Å3/Da / 溶媒含有率: 73.26 % | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS pH: 7 / 手法: 蒸気拡散法 / 詳細: referred to J.Mol.Biol. 125.325-338 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-解析
精密化 | 最高解像度: 2.9 Å 詳細: ATOMS WITH AN OCCUPANCY OF 0.0 ARE POORLY DEFINED IN THE DENSITY. | ||||||||||||
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 最高解像度: 2.9 Å
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