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-基本情報
登録情報 | データベース: EMDB / ID: EMD-34662 | |||||||||
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タイトル | TOM-TIM23 supercomplex with a GFP and DHFR containing substrate | |||||||||
マップデータ | ||||||||||
試料 |
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キーワード | Mitochondrial protein import (ミトコンドリア) / TOM40 / TIM23 / PROTEIN TRANSPORT | |||||||||
生物種 | Saccharomyces cerevisiae S288C (パン酵母) | |||||||||
手法 | 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 9.99 Å | |||||||||
データ登録者 | Zhou XY / Yang YQ / Wang GP / Wang SS | |||||||||
資金援助 | 中国, 1件
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引用 | ジャーナル: Nat.Struct.Mol.Biol. / 年: 2023 タイトル: Molecular pathway of mitochondrial preprotein import through the TOM-TIM23 supercomplex 著者: Zhou XY / Yang YQ / Wang GP / Wang SS / Sun DJ / Ou XM / Lian Y / Li L | |||||||||
履歴 |
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-構造の表示
添付画像 |
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-ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | emd_34662.map.gz | 7.9 MB | EMDBマップデータ形式 | |
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ヘッダ (付随情報) | emd-34662-v30.xml emd-34662.xml | 12.9 KB 12.9 KB | 表示 表示 | EMDBヘッダ |
FSC (解像度算出) | emd_34662_fsc.xml | 10.1 KB | 表示 | FSCデータファイル |
画像 | emd_34662.png | 20.4 KB | ||
その他 | emd_34662_half_map_1.map.gz emd_34662_half_map_2.map.gz | 65.2 MB 65.2 MB | ||
アーカイブディレクトリ | http://ftp.pdbj.org/pub/emdb/structures/EMD-34662 ftp://ftp.pdbj.org/pub/emdb/structures/EMD-34662 | HTTPS FTP |
-リンク
EMDBのページ | EMDB (EBI/PDBe) / EMDataResource |
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-マップ
ファイル | ダウンロード / ファイル: emd_34662.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 83.7 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES) | ||||||||||||||||||||
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ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 1.07 Å | ||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
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-添付データ
-ハーフマップ: #2
ファイル | emd_34662_half_map_1.map | ||||||||||||
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投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-ハーフマップ: #1
ファイル | emd_34662_half_map_2.map | ||||||||||||
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投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-試料の構成要素
-全体 : TOM-TIM23 supercomplex with a GFP and DHFR containing substrate
全体 | 名称: TOM-TIM23 supercomplex with a GFP and DHFR containing substrate |
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要素 |
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-超分子 #1: TOM-TIM23 supercomplex with a GFP and DHFR containing substrate
超分子 | 名称: TOM-TIM23 supercomplex with a GFP and DHFR containing substrate タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1 |
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由来(天然) | 生物種: Saccharomyces cerevisiae S288C (パン酵母) |
-実験情報
-構造解析
手法 | クライオ電子顕微鏡法 |
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解析 | 単粒子再構成法 |
試料の集合状態 | particle |
-試料調製
緩衝液 | pH: 8 |
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グリッド | モデル: Quantifoil R1.2/1.3 / 材質: GOLD / メッシュ: 300 |
凍結 | 凍結剤: ETHANE |
-電子顕微鏡法
顕微鏡 | FEI TITAN KRIOS |
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電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN |
電子光学系 | 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELDBright-field microscopy / 最大 デフォーカス(公称値): 1.2 µm / 最小 デフォーカス(公称値): 1.0 µm |
特殊光学系 | エネルギーフィルター - 名称: GIF Bioquantum / エネルギーフィルター - スリット幅: 20 eV |
撮影 | フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 BIOQUANTUM (6k x 4k) 平均電子線量: 60.0 e/Å2 |
実験機器 | モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |