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- EMDB-12535: Structure of the yeast Gcn1 bound to a colliding stalled 80S ribo... -

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登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-12535
タイトルStructure of the yeast Gcn1 bound to a colliding stalled 80S ribosome with MBF1, A/P-tRNA and P/E-tRNA
マップデータmap colliding ribosome
試料
  • 複合体: Structure of the yeast Gcn1-bound coilliding stalled 80S ribosome with MBF1, Gir2, A/P-tRNA and P/E-tRNA
    • RNA: x 7種
    • タンパク質・ペプチド: x 75種
機能・相同性
機能・相同性情報


maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, LSU-rRNA,5S) / negative regulation of glucose mediated signaling pathway / negative regulation of translational frameshifting / Protein methylation / positive regulation of translational fidelity / RMTs methylate histone arginines / mTORC1-mediated signalling / ribosome-associated ubiquitin-dependent protein catabolic process / ヒドロキシル化 / GDP-dissociation inhibitor activity ...maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, LSU-rRNA,5S) / negative regulation of glucose mediated signaling pathway / negative regulation of translational frameshifting / Protein methylation / positive regulation of translational fidelity / RMTs methylate histone arginines / mTORC1-mediated signalling / ribosome-associated ubiquitin-dependent protein catabolic process / ヒドロキシル化 / GDP-dissociation inhibitor activity / : / pre-mRNA 5'-splice site binding / positive regulation of nuclear-transcribed mRNA catabolic process, deadenylation-dependent decay / Formation of the ternary complex, and subsequently, the 43S complex / Translation initiation complex formation / Ribosomal scanning and start codon recognition / cleavage in ITS2 between 5.8S rRNA and LSU-rRNA of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) / preribosome, small subunit precursor / response to cycloheximide / mRNA destabilization / Major pathway of rRNA processing in the nucleolus and cytosol / SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane / GTP hydrolysis and joining of the 60S ribosomal subunit / Formation of a pool of free 40S subunits / endonucleolytic cleavage to generate mature 3'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) / Nonsense Mediated Decay (NMD) independent of the Exon Junction Complex (EJC) / Nonsense Mediated Decay (NMD) enhanced by the Exon Junction Complex (EJC) / protein-RNA complex assembly / 90S preribosome / negative regulation of mRNA splicing, via spliceosome / ribosomal small subunit export from nucleus / preribosome, large subunit precursor / L13a-mediated translational silencing of Ceruloplasmin expression / translation regulator activity / ribosomal large subunit export from nucleus / G-protein alpha-subunit binding / endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) / regulation of translational fidelity / positive regulation of protein kinase activity / rescue of stalled ribosome / translational termination / maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) / maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) / maturation of SSU-rRNA / ribosomal large subunit biogenesis / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease activity / maturation of LSU-rRNA / cellular response to amino acid starvation / ribosome assembly / small-subunit processome / protein kinase C binding / maintenance of translational fidelity / オートファジー / modification-dependent protein catabolic process / ribosomal large subunit assembly / protein tag activity / ribosomal small subunit biogenesis / rRNA processing / ribosomal small subunit assembly / small ribosomal subunit rRNA binding / cytoplasmic stress granule / ribosome binding / リボソーム生合成 / cytosolic small ribosomal subunit / large ribosomal subunit rRNA binding / small ribosomal subunit / 5S rRNA binding / cytoplasmic translation / cytosolic large ribosomal subunit / negative regulation of translation / transcription coactivator activity / rRNA binding / protein ubiquitination / リボソーム / structural constituent of ribosome / positive regulation of protein phosphorylation / 翻訳 (生物学) / G protein-coupled receptor signaling pathway / response to antibiotic / negative regulation of gene expression / mRNA binding / ubiquitin protein ligase binding / 核小体 / positive regulation of transcription by RNA polymerase II / ミトコンドリア / DNA binding / RNA binding / zinc ion binding / 核質 / metal ion binding / 細胞核 / 細胞質基質 / 細胞質
類似検索 - 分子機能
Multiprotein bridging factor 1, N-terminal / Multiprotein bridging factor 1 / ヘリックスターンヘリックス / Helix-turn-helix XRE-family like proteins / Cro/C1-type HTH domain profile. / Cro/C1-type helix-turn-helix domain / : / Ribosomal protein L41 / Ribosomal protein L41 / : ...Multiprotein bridging factor 1, N-terminal / Multiprotein bridging factor 1 / ヘリックスターンヘリックス / Helix-turn-helix XRE-family like proteins / Cro/C1-type HTH domain profile. / Cro/C1-type helix-turn-helix domain / : / Ribosomal protein L41 / Ribosomal protein L41 / : / Ribosomal protein S12e / Small (40S) ribosomal subunit Asc1/RACK1 / Ribosomal protein S21e, conserved site / Ribosomal protein S26e / Ribosomal protein S26e superfamily / Ribosomal protein S19e, conserved site / Lambda repressor-like, DNA-binding domain superfamily / Ribosomal protein L29e / S27a-like superfamily / Ribosomal protein S26e / Ribosomal protein S26e signature. / Ribosomal protein S10, eukaryotic/archaeal / Ribosomal protein S17e, conserved site / Ribosomal protein S25 / : / Ribosomal protein S2, eukaryotic / Ribosomal protein S30 / 40S ribosomal protein S29/30S ribosomal protein S14 type Z / Ribosomal protein S27a / Ribosomal L29e protein family / Ribosomal protein S27a / Ribosomal protein S21e / Ribosomal protein S21e superfamily / Ribosomal protein S21e / Ribosomal protein S3, eukaryotic/archaeal / Ribosomal protein L10e, conserved site / Ribosomal protein L27e, conserved site / Ribosomal protein S8e subdomain, eukaryotes / Ribosomal protein L10e / S25 ribosomal protein / Ribosomal protein S21e signature. / Ribosomal protein S19A/S15e / Ribosomal protein S3Ae, conserved site / Ribosomal protein S30 / Ribosomal protein S12e signature. / Ribosomal protein S17e / Ribosomal protein S17e-like superfamily / Ribosomal protein S27a / Ribosomal protein S2, eukaryotic/archaeal / Ribosomal protein S19e / Ribosomal_S19e / Ribosomal protein S5, eukaryotic/archaeal / 40S ribosomal protein S11, N-terminal / : / Ribosomal protein S8e, conserved site / Ribosomal protein L24e, conserved site / 40S ribosomal protein S1/3, eukaryotes / Ribosomal protein S6, eukaryotic / Ribosomal protein L34e, conserved site / Ribosomal protein S7e / Ribosomal protein S4e, N-terminal, conserved site / 40S ribosomal protein S4, C-terminal domain / Eukaryotic Ribosomal Protein L27, KOW domain / Ribosomal protein S19e signature. / Ribosomal protein L38e / Ribosomal protein L38e superfamily / Ribosomal protein L27e / Ribosomal protein L27e superfamily / Ribosomal S17 / Ribosomal protein L22e / Ribosomal protein L22e superfamily / Ribosomal protein L23/L25, N-terminal / Ribosomal L38e protein family / Ribosomal protein S19e / Ribosomal protein S27, zinc-binding domain superfamily / Ribosomal L22e protein family / Ribosomal protein S17, archaeal/eukaryotic / 40S Ribosomal protein S10 / 60S ribosomal protein L35 / Ribosomal protein S27 / Ribosomal protein L35Ae, conserved site / Ribosomal protein S28e conserved site / Ribosomal protein S6/S6e/A/B/2, conserved site / Ribosomal protein L30e, conserved site / Ribosomal protein S28e / 40S ribosomal protein S4 C-terminus / Ribosomal protein S4e, N-terminal / Ribosomal_S17 N-terminal / Ribosomal protein L23, N-terminal domain / Ribosomal protein S23, eukaryotic/archaeal / Ribosomal protein L34Ae / Ribosomal protein L13e, conserved site / Ribosomal protein L13e signature. / Ribosomal protein S3Ae / Plectin/S10, N-terminal / Ribosomal S3Ae family / Ribosomal protein S7e / Ribosomal L27e protein family / Plectin/S10 domain / Ribosomal protein S8e
類似検索 - ドメイン・相同性
Small ribosomal subunit protein uS4A / Multiprotein-bridging factor 1 / Large ribosomal subunit protein uL15 / Large ribosomal subunit protein eL24A / Large ribosomal subunit protein uL23 / Large ribosomal subunit protein eL39 / Large ribosomal subunit protein uL30A / Large ribosomal subunit protein uL6A / Large ribosomal subunit protein eL6B / Large ribosomal subunit protein uL22A ...Small ribosomal subunit protein uS4A / Multiprotein-bridging factor 1 / Large ribosomal subunit protein uL15 / Large ribosomal subunit protein eL24A / Large ribosomal subunit protein uL23 / Large ribosomal subunit protein eL39 / Large ribosomal subunit protein uL30A / Large ribosomal subunit protein uL6A / Large ribosomal subunit protein eL6B / Large ribosomal subunit protein uL22A / Large ribosomal subunit protein uL24A / Large ribosomal subunit protein eL33A / Large ribosomal subunit protein eL36A / Large ribosomal subunit protein eL29 / Large ribosomal subunit protein eL15A / Large ribosomal subunit protein eL22A / Small ribosomal subunit protein uS3 / Small ribosomal subunit protein uS15 / Ubiquitin-ribosomal protein eS31 fusion protein / Small ribosomal subunit protein eS19A / Small ribosomal subunit protein eS21A / Small ribosomal subunit protein uS8A / Large ribosomal subunit protein eL27A / Large ribosomal subunit protein eL31A / Ubiquitin-ribosomal protein eL40A fusion protein / Large ribosomal subunit protein eL20A / Large ribosomal subunit protein eL43A / Large ribosomal subunit protein eL42A / Small ribosomal subunit protein uS12A / Small ribosomal subunit protein eS24A / Small ribosomal subunit protein eS30A / Small ribosomal subunit protein eS4A / Small ribosomal subunit protein eS6A / Small ribosomal subunit protein eS8A / Large ribosomal subunit protein uL14A / Large ribosomal subunit protein uL2A / Small ribosomal subunit protein uS17A / Large ribosomal subunit protein eL18A / Small ribosomal subunit protein uS9A / Small ribosomal subunit protein uS13A / Large ribosomal subunit protein eL19A / Large ribosomal subunit protein uL29A / Small ribosomal subunit protein eS32B / Large ribosomal subunit protein uL4A / Large ribosomal subunit protein eL30 / Large ribosomal subunit protein uL3 / Small ribosomal subunit protein eS17B / Large ribosomal subunit protein eL8A / Small ribosomal subunit protein uS5 / Large ribosomal subunit protein uL18 / Small ribosomal subunit protein uS7 / Large ribosomal subunit protein uL13A / Small ribosomal subunit protein eS7A / Small ribosomal subunit protein uS2A / Small ribosomal subunit protein eS1A / Small ribosomal subunit protein eS27A / Large ribosomal subunit protein eL14A / Small ribosomal subunit protein RACK1 / Large ribosomal subunit protein eL32 / Small ribosomal subunit protein uS10 / Small ribosomal subunit protein uS11B / Small ribosomal subunit protein eS26B / Small ribosomal subunit protein uS14A / Large ribosomal subunit protein uL16 / Small ribosomal subunit protein eS12 / Large ribosomal subunit protein eL37A / Large ribosomal subunit protein eL38 / Large ribosomal subunit protein eL34A / Small ribosomal subunit protein uS19 / Large ribosomal subunit protein eL21A / Small ribosomal subunit protein eS10A / Large ribosomal subunit protein eL13A / Large ribosomal subunit protein uL5B / Small ribosomal subunit protein eS25A / Small ribosomal subunit protein eS28A
類似検索 - 構成要素
生物種Saccharomyces cerevisiae S288c (パン酵母) / Saccharomyces cerevisiae S288C (パン酵母) / Baker's yeast (パン酵母)
手法単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 4.36 Å
データ登録者Pochopien AA / Beckert B / Wilson DN
資金援助 ドイツ, 2件
OrganizationGrant number国
German Research Foundation (DFG)WI3285/8-1 ドイツ
German Research Foundation (DFG)SPP-1879 ドイツ
引用ジャーナル: Proc Natl Acad Sci U S A / 年: 2021
タイトル: Structure of Gcn1 bound to stalled and colliding 80S ribosomes.
著者: Agnieszka A Pochopien / Bertrand Beckert / Sergo Kasvandik / Otto Berninghausen / Roland Beckmann / Tanel Tenson / Daniel N Wilson /
要旨: The Gcn pathway is conserved in all eukaryotes, including mammals such as humans, where it is a crucial part of the integrated stress response (ISR). Gcn1 serves as an essential effector protein for ...The Gcn pathway is conserved in all eukaryotes, including mammals such as humans, where it is a crucial part of the integrated stress response (ISR). Gcn1 serves as an essential effector protein for the kinase Gcn2, which in turn is activated by stalled ribosomes, leading to phosphorylation of eIF2 and a subsequent global repression of translation. The fine-tuning of this adaptive response is performed by the Rbg2/Gir2 complex, a negative regulator of Gcn2. Despite the wealth of available biochemical data, information on structures of Gcn proteins on the ribosome has remained elusive. Here we present a cryo-electron microscopy structure of the yeast Gcn1 protein in complex with stalled and colliding 80S ribosomes. Gcn1 interacts with both 80S ribosomes within the disome, such that the Gcn1 HEAT repeats span from the P-stalk region on the colliding ribosome to the P-stalk and the A-site region of the lead ribosome. The lead ribosome is stalled in a nonrotated state with peptidyl-tRNA in the A-site, uncharged tRNA in the P-site, eIF5A in the E-site, and Rbg2/Gir2 in the A-site factor binding region. By contrast, the colliding ribosome adopts a rotated state with peptidyl-tRNA in a hybrid A/P-site, uncharged-tRNA in the P/E-site, and Mbf1 bound adjacent to the mRNA entry channel on the 40S subunit. Collectively, our findings reveal the interaction mode of the Gcn2-activating protein Gcn1 with colliding ribosomes and provide insight into the regulation of Gcn2 activation. The binding of Gcn1 to a disome has important implications not only for the Gcn2-activated ISR, but also for the general ribosome-associated quality control pathways.
履歴
登録2021年3月3日-
ヘッダ(付随情報) 公開2021年4月14日-
マップ公開2021年4月14日-
更新2021年4月14日-
現状2021年4月14日処理サイト: PDBe / 状態: 公開

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構造の表示

ムービー
  • 表面図（断面を密度値に従い着色）
  • 表面レベル: 0.03
  • UCSF Chimeraによる作画
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  • 表面図（高さに従い着色）
  • 表面レベル: 0.03
  • UCSF Chimeraによる作画
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  • 原子モデル: PDB-7nrd
  • 表面レベル: 0.03
  • UCSF Chimeraによる作画
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  • 単純化した表面モデル + あてはめた原子モデル
  • 原子モデルPDB-7nrd
  • Jmolによる作画
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ムービービューア
構造ビューアEMマップ:
SurfViewMolmilJmol/JSmol
添付画像

emd_12535.png

ダウンロードとリンク

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マップ

ファイルダウンロード / ファイル: emd_12535.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 1.3 GB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
注釈map colliding ribosome
ボクセルのサイズX=Y=Z: 1.084 Å
密度
表面レベル登録者による: 0.03 / ムービー #1: 0.03
最小 - 最大-0.31267092 - 0.5077412
平均 (標準偏差)0.0007687183 (±0.0064846477)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderXYZ
Origin000
サイズ700700700
Spacing700700700
セルA=B=C: 758.8 Å
α=β=γ: 90.0 °

CCP4マップ ヘッダ情報:

modeImage stored as Reals
Å/pix. X/Y/Z1.0841.0841.084
M x/y/z700700700
origin x/y/z0.0000.0000.000
length x/y/z758.800758.800758.800
α/β/γ90.00090.00090.000
MAP C/R/S123
start NC/NR/NS000
NC/NR/NS700700700
D min/max/mean-0.3130.5080.001

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添付データ

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追加マップ: map colliding ribosome relion final run

ファイルemd_12535_additional_1.map
注釈map colliding ribosome relion final run
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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追加マップ: focus refinement 40S only and postprocess

ファイルemd_12535_additional_2.map
注釈focus refinement 40S only and postprocess
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

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密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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追加マップ: map colliding ribosome postprocess

ファイルemd_12535_additional_3.map
注釈map colliding ribosome postprocess
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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ハーフマップ: Half map colliding ribosome

ファイルemd_12535_half_map_1.map
注釈Half map colliding ribosome
投影像・断面図
軸ZYX

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密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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ハーフマップ: Half map colliding ribosome

ファイルemd_12535_half_map_2.map
注釈Half map colliding ribosome
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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試料の構成要素

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全体 : Structure of the yeast Gcn1-bound coilliding stalled 80S ribosome...

全体名称: Structure of the yeast Gcn1-bound coilliding stalled 80S ribosome with MBF1, Gir2, A/P-tRNA and P/E-tRNA
要素
  • 複合体: Structure of the yeast Gcn1-bound coilliding stalled 80S ribosome with MBF1, Gir2, A/P-tRNA and P/E-tRNA
    • RNA: TPA_inf: Saccharomyces cerevisiae S288C chromosome XII, complete sequence
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S3
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S5
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S10-Aリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S12
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S15
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S16-Aリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S17-Bリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S18-Aリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S19-Aリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S20
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S25-Aリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S28-Aリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S29-Aリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: Ubiquitin-40S ribosomal protein S31
    • タンパク質・ペプチド: Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-like protein
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S0-Aリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S1-Aリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S2
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S4-Aリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S6-Aリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S7-Aリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S8-Aリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S9-Aリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S11-Aリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S13
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S14-Bリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S21-Aリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S22-Aリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S23-Aリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S24-Aリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S26-Bリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S27-Aリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S30-Aリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: Multiprotein-bridging factor 1
    • RNA: mRNA (32-MER)
    • RNA: tRNA (75-MER)
    • RNA: tRNA (77-MER)
    • RNA: 25S rRNA (3184-MER)
    • RNA: 5S rRNA (121-MER)
    • RNA: 5.8S rRNA (158-MER)
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L2-Aリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L3
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L4-Aリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L5
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L6-Bリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L7-Aリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L8-Aリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L9-Aリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L10
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L11-Bリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L13-Aリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L14-Aリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L15-Aリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L16-Aリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L17-Aリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L18-Aリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L19-Aリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L20-Aリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L21-Aリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L22-Aリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L23-Aリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L24-Aリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L25
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L26-Aリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L27-Aリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L28
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L29
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L30
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L31-Aリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L32
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L33-Aリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L34-Aリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L35-Aリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L36-Aリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L37-Aリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L38
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L39
    • タンパク質・ペプチド: Ubiquitin-60S ribosomal protein L40
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L41-Bリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L42-Aリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L43-Aリボソーム

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超分子 #1: Structure of the yeast Gcn1-bound coilliding stalled 80S ribosome...

超分子名称: Structure of the yeast Gcn1-bound coilliding stalled 80S ribosome with MBF1, Gir2, A/P-tRNA and P/E-tRNA
タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#82
由来(天然)生物種: Saccharomyces cerevisiae S288c (パン酵母)

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分子 #1: TPA_inf: Saccharomyces cerevisiae S288C chromosome XII, complete ...

分子名称: TPA_inf: Saccharomyces cerevisiae S288C chromosome XII, complete sequence
タイプ: rna / ID: 1 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Saccharomyces cerevisiae S288C (パン酵母)
分子量理論値: 579.761938 KDa
配列文字列: UAUCUGGUUG AUCCUGCCAG UAGUCAUAUG CUUGUCUCAA AGAUUAAGCC AUGCAUGUCU AAGUAUAAGC AAUUUAUACA GUGAAACUG CGAAUGGCUC AUUAAAUCAG UUAUCGUUUA UUUGAUAGUU CCUUUACUAC AUGGUAUAAC UGUGGUAAUU C UAGAGCUA ...文字列:
UAUCUGGUUG AUCCUGCCAG UAGUCAUAUG CUUGUCUCAA AGAUUAAGCC AUGCAUGUCU AAGUAUAAGC AAUUUAUACA GUGAAACUG CGAAUGGCUC AUUAAAUCAG UUAUCGUUUA UUUGAUAGUU CCUUUACUAC AUGGUAUAAC UGUGGUAAUU C UAGAGCUA AUACAUGCUU AAAAUCUCGA CCCUUUGGAA GAGAUGUAUU UAUUAGAUAA AAAAUCAAUG UCUUCGGACU CU UUGAUGA UUCAUAAUAA CUUUUCGAAU CGCAUGGCCU UGUGCUGGCG AUGGUUCAUU CAAAUUUCUG CCCUAUCAAC UUU CGAUGG UAGGAUAGUG GCCUACCAUG GUUUCAACGG GUAACGGGGA AUAAGGGUUC GAUUCCGGAG AGGGAGCCUG AGAA ACGGC UACCACAUCC AAGGAAGGCA GCAGGCGCGC AAAUUACCCA AUCCUAAUUC AGGGAGGUAG UGACAAUAAA UAACG AUAC AGGGCCCAUU CGGGUCUUGU AAUUGGAAUG AGUACAAUGU AAAUACCUUA ACGAGGAACA AUUGGAGGGC AAGUCU GGU GCCAGCAGCC GCGGUAAUUC CAGCUCCAAU AGCGUAUAUU AAAGUUGUUG CAGUUAAAAA GCUCGUAGUU GAACUUU GG GCCCGGUUGG CCGGUCCGAU UUUUUCGUGU ACUGGAUUUC CAACGGGGCC UUUCCUUCUG GCUAACCUUG AGUCCUUG U GGCUCUUGGC GAACCAGGAC UUUUACUUUG AAAAAAUUAG AGUGUUCAAA GCAGGCGUAU UGCUCGAAUA UAUUAGCAU GGAAUAAUAG AAUAGGACGU UUGGUUCUAU UUUGUUGGUU UCUAGGACCA UCGUAAUGAU UAAUAGGGAC GGUCGGGGGC AUCAGUAUU CAAUUGUCAG AGGUGAAAUU CUUGGAUUUA UUGAAGACUA ACUACUGCGA AAGCAUUUGC CAAGGACGUU U UCAUUAAU CAAGAACGAA AGUUAGGGGA UCGAAGAUGA UCAGAUACCG UCGUAGUCUU AACCAUAAAC UAUGCCGACU AG GGAUCGG GUGGUGUUUU UUUAAUGACC CACUCGGCAC CUUACGAGAA AUCAAAGUCU UUGGGUUCUG GGGGGAGUAU GGU CGCAAG GCUGAAACUU AAAGGAAUUG ACGGAAGGGC ACCACCAGGA GUGGAGCCUG CGGCUUAAUU UGACUCAACA CGGG GAAAC UCACCAGGUC CAGACACAAU AAGGAUUGAC AGAUUGAGAG CUCUUUCUUG AUUUUGUGGG UGGUGGUGCA UGGCC GUUC UUAGUUGGUG GAGUGAUUUG UCUGCUUAAU UGCGAUAACG AACGAGACCU UAACCUACUA AAUAGUGGUG CUAGCA UUU GCUGGUUAUC CACUUCUUAG AGGGACUAUC GGUUUCAAGC CGAUGGAAGU UUGAGGCAAU AACAGGUCUG UGAUGCC CU UAGACGUUCU GGGCCGCACG CGCGCUACAC UGACGGAGCC AGCGAGUCUA ACCUUGGCCG AGAGGUCUUG GUAAUCUU G UGAAACUCCG UCGUGCUGGG GAUAGAGCAU UGUAAUUAUU GCUCUUCAAC GAGGAAUUCC UAGUAAGCGC AAGUCAUCA GCUUGCGUUG AUUACGUCCC UGCCCUUUGU ACACACCGCC CGUCGCUAGU ACCGAUUGAA UGGCUUAGUG AGGCCUCAGG AUCUGCUUA GAGAAGGGGG CAACUCCAUC UCAGAGCGGA GAAUUUGGAC AAACUUGGUC AUUUAGAGGA ACUAAAAGUC G UAACAAGG UUUCCGUAGG UGAACCUGCG GAAGGAUCAU UA

+
分子 #36: mRNA (32-MER)

分子名称: mRNA (32-MER) / タイプ: rna / ID: 36 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Saccharomyces cerevisiae S288c (パン酵母)
分子量理論値: 9.885666 KDa
配列文字列:
ACUAUAAAAU UUUCUUUUCU CUCUUUUUUU UU

+
分子 #37: tRNA (75-MER)

分子名称: tRNA (75-MER) / タイプ: rna / ID: 37 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 24.2225 KDa
配列文字列:
AGCGCCGUGA CGCAGUGGAA GCGCGCAGGG CUCAUAACCC UGAUGUCCUC GGAUCGAAAC CGAGCGGCGC UACCA

+
分子 #38: tRNA (77-MER)

分子名称: tRNA (77-MER) / タイプ: rna / ID: 38 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Saccharomyces cerevisiae S288c (パン酵母)
分子量理論値: 24.802785 KDa
配列文字列:
CGCGGGGUGG AGCAGCCUGG UAGCUCGUCG GGCUCAUAAC CCGAAGGUCG UCGGUUCAAA UCCGGCCCCC GCAACCA

+
分子 #39: 25S rRNA (3184-MER)

分子名称: 25S rRNA (3184-MER) / タイプ: rna / ID: 39 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Saccharomyces cerevisiae S288C (パン酵母)
分子量理論値: 1.096842375 MDa
配列文字列: UUGACCUCAA AUCAGGUAGG AGUACCCGCU GAACUUAAGC AUAUCAAUAA GCGGAGGAAA AGAAACCAAC CGGGAUUGCC UUAGUAACG GCGAGUGAAG CGGCAAAAGC UCAAAUUUGA AAUCUGGUAC CUUCGGUGCC CGAGUUGUAA UUUGGAGAGG G CAACUUUG ...文字列:
UUGACCUCAA AUCAGGUAGG AGUACCCGCU GAACUUAAGC AUAUCAAUAA GCGGAGGAAA AGAAACCAAC CGGGAUUGCC UUAGUAACG GCGAGUGAAG CGGCAAAAGC UCAAAUUUGA AAUCUGGUAC CUUCGGUGCC CGAGUUGUAA UUUGGAGAGG G CAACUUUG GGGCCGUUCC UUGUCUAUGU UCCUUGGAAC AGGACGUCAU AGAGGGUGAG AAUCCCGUGU GGCGAGGAGU GC GGUUCUU UGUAAAGUGC CUUCGAAGAG UCGAGUUGUU UGGGAAUGCA GCUCUAAGUG GGUGGUAAAU UCCAUCUAAA GCU AAAUAU UGGCGAGAGA CCGAUAGCGA ACAAGUACAG UGAUGGAAAG AUGAAAAGAA CUUUGAAAAG AGAGUGAAAA AGUA CGUGA AAUUGUUGAA AGGGAAGGGC AUUUGAUCAG ACAUGGUGUU UUGUGCCCUC UGCUCCUUGU GGGUAGGGGA AUCUC GCAU UUCACUGGGC CAGCAUCAGU UUUGGUGGCA GGAUAAAUCC AUAGGAAUGU AGCUUGCCUC GGUAAGUAUU AUAGCC UGU GGGAAUACUG CCAGCUGGGA CUGAGGACUG CGACGUAAGU CAAGGAUGCU GGCAUAAUGG UUAUAUGCCG CCCGUCU UG AAACACGGAC CAAGGAGUCU AACGUCUAUG CGAGUGUUUG GGUGUAAAAC CCAUACGCGU AAUGAAAGUG AACGUAGG U UGGGGCCUCG CAAGAGGUGC ACAAUCGACC GAUCCUGAUG UCUUCGGAUG GAUUUGAGUA AGAGCAUAGC UGUUGGGAC CCGAAAGAUG GUGAACUAUG CCUGAAUAGG GUGAAGCCAG AGGAAACUCU GGUGGAGGCU CGUAGCGGUU CUGACGUGCA AAUCGAUCG UCGAAUUUGG GUAUAGGGGC GAAAGACUAA UCGAACCAUC UAGUAGCUGG UUCCUGCCGA AGUUUCCCUC A GGAUAGCA GAAGCUCGUA UCAGUUUUAU GAGGUAAAGC GAAUGAUUAG AGGUUCCGGG GUCGAAAUGA CCUUGACCUA UU CUCAAAC UUUAAAUAUG UAAGAAGUCC UUGUUACUUA AUUGAACGUG GACAUUUGAA UGAAGAGCUU UUAGUGGGCC AUU UUUGGU AAGCAGAACU GGCGAUGCGG GAUGAACCGA ACGUAGAGUU AAGGUGCCGG AAUACACGCU CAUCAGACAC CACA AAAGG UGUUAGUUCA UCUAGACAGC CGGACGGUGG CCAUGGAAGU CGGAAUCCGC UAAGGAGUGU GUAACAACUC ACCGG CCGA AUGAACUAGC CCUGAAAAUG GAUGGCGCUC AAGCGUGUUA CCUAUACUCU ACCGUCAGGG UUGAUAUGAU GCCCUG ACG AGUAGGCAGG CGUGGAGGUC AGUGACGAAG CCUAGACCGU AAGGUCGGGU CGAACGGCCU CUAGUGCAGA UCUUGGU GG UAGUAGCAAA UAUUCAAAUG AGAACUUUGA AGACUGAAGU GGGGAAAGGU UCCACGUCAA CAGCAGUUGG ACGUGGGU U AGUCGAUCCU AAGAGAUGGG GAAGCUCCGU UUCAAAGGCC UGAUUUUAUG CAGGCCACCA UCGAAAGGGA AUCCGGUUA AGAUUCCGGA ACCUGGAUAU GGAUUCUUCA CGGUAACGUA ACUGAAUGUG GAGACGUCGG CGCGAGCCCU GGGAGGAGUU AUCUUUUCU UCUUAACAGC UUAUCACCCC GGAAUUGGUU UAUCCGGAGA UGGGGUCUUA UGGCUGGAAG AGGCCAGCAC C UUUGCUGG CUCCGGUGCG CUUGUGACGG CCCGUGAAAA UCCACAGGAA GGAAUAGUUU UCAUGCCAGG UCGUACUGAU AA CCGCAGC AGGUCUCCAA GGUGAACAGC CUCUAGUUGA UAGAAUAAUG UAGAUAAGGG AAGUCGGCAA AAUAGAUCCG UAA CUUCGG GAUAAGGAUU GGCUCUAAGG GUCGGGUAGU GAGGGCCUUG GUCAGACGCA GCGGGCGUGC UUGUGGACUG CUUG GUGGG GCUUGCUCUG CUAGGCGGAC UACUUGCGUG CCUUGUUGUA GACGGCCUUG GUAGGUCUCU UGUAGACCGU CGCUU GCUA CAAUUAACGA UCAACUUAGA ACUGGUACGG ACAAGGGGAA UCUGACUGUC UAAUUAAAAC AUAGCAUUGC GAUGGU CAG AAAGUGAUGU UGACGCAAUG UGAUUUCUGC CCAGUGCUCU GAAUGUCAAA GUGAAGAAAU UCAACCAAGC GCGGGUA AA CGGCGGGAGU AACUAUGACU CUCUUAAGGU AGCCAAAUGC CUCGUCAUCU AAUUAGUGAC GCGCAUGAAU GGAUUAAC G AGAUUCCCAC UGUCCCUAUC UACUAUCUAG CGAAACCACA GCCAAGGGAA CGGGCUUGGC AGAAUCAGCG GGGAAAGAA GACCCUGUUG AGCUUGACUC UAGUUUGACA UUGUGAAGAG ACAUAGAGGG UGUAGAAUAA GUGGGAGCUU CGGCGCCAGU GAAAUACCA CUACCUUUAU AGUUUCUUUA CUUAUUCAAU GAAGCGGAGC UGGAAUUCAU UUUCCACGUU CUAGCAUUCA A GGUCCCAU UCGGGGCUGA UCCGGGUUGA AGACAUUGUC AGGUGGGGAG UUUGGCUGGG GCGGCACAUC UGUUAAACGA UA ACGCAGA UGUCCUAAGG GGGGCUCAUG GAGAACAGAA AUCUCCAGUA GAACAAAAGG GUAAAAGCCC CCUUGAUUUU GAU UUUCAG UGUGAAUACA AACCAUGAAA GUGUGGCCUA UCGAUCCUUU AGUCCCUCGG AAUUUGAGGC UAGAGGUGCC AGAA AAGUU ACCACAGGGA UAACUGGCUU GUGGCAGUCA AGCGUUCAUA GCGACAUUGC UUUUUGAUUC UUCGAUGUCG GCUCU UCCU AUCAUACCGA AGCAGAAUUC GGUAAGCGUU GGAUUGUUCA CCCACUAAUA GGGAACGUGA GCUGGGUUUA GACCGU CGU GAGACAGGUU AGUUUUACCC UACUGAUGAA UGUUACCGCA AUAGUAAUUG AACUUAGUAC GAGAGGAACA GUUCAUU CG GAUAAUUGGU UUUUGCGGCU GUCUGAUCAG GCAUUGCCGC GAAGCUACCA UCCGCUGGAU UAUGGCUGAA CGCCUCUA A GUCAGAAUCC AUGCUAGAAC GCGGUGAUUU CUUUGCUCCA CACAAUAUAG AUGGAUACGA AUAAGGCGUC CUUGUGGCG UCGCUGAACC AUAGCAGGCU AGCAACGGUG CACUUGGCGG AAAGGCCUUG GGUGCUUGCU GGCGAAUUGC AAUGUCAUUU UGCGUGGGG AUAAAUCAUU UGUAUACGAC UUAGAUGUAC AACGGGGUAU UGUAAGCAGU AGAGUAGCCU UGUUGUUACG A UCUGCUGA GAUUAAGCCU UUGUUGUCUG AUUUGU

+
分子 #40: 5S rRNA (121-MER)

分子名称: 5S rRNA (121-MER) / タイプ: rna / ID: 40 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Saccharomyces cerevisiae S288c (パン酵母)
分子量理論値: 38.951105 KDa
配列文字列:
GGUUGCGGCC AUAUCUACCA GAAAGCACCG UUUCCCGUCC GAUCAACUGU AGUUAAGCUG GUAAGAGCCU GACCGAGUAG UGUAGUGGG UGACCAUACG CGAAACUCAG GUGCUGCAAU CU

+
分子 #41: 5.8S rRNA (158-MER)

分子名称: 5.8S rRNA (158-MER) / タイプ: rna / ID: 41 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Saccharomyces cerevisiae S288c (パン酵母)
分子量理論値: 50.682922 KDa
配列文字列:
AAACUUUCAA CAACGGAUCU CUUGGUUCUC GCAUCGAUGA AGAACGCAGC GAAAUGCGAU ACGUAAUGUG AAUUGCAGAA UUCCGUGAA UCAUCGAAUC UUUGAACGCA CAUUGCGCCC CUUGGUAUUC CAGGGGGCAU GCCUGUUUGA GCGUCAUUU

+
分子 #2: 40S ribosomal protein S3

分子名称: 40S ribosomal protein S3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 24.702791 KDa
配列文字列: ALISKKRKLV ADGVFYAELN EFFTRELAEE GYSGVEVRVT PTKTEVIIRA TRTQDVLGEN GRRINELTLL VQKRFKYAPG TIVLYAERV QDRGLSAVAQ AESMKFKLLN GLAIRRAAYG VVRYVMESGA KGCEVVVSGK LRAARAKAMK FADGFLIHSG Q PVNDFIDT ...文字列:
ALISKKRKLV ADGVFYAELN EFFTRELAEE GYSGVEVRVT PTKTEVIIRA TRTQDVLGEN GRRINELTLL VQKRFKYAPG TIVLYAERV QDRGLSAVAQ AESMKFKLLN GLAIRRAAYG VVRYVMESGA KGCEVVVSGK LRAARAKAMK FADGFLIHSG Q PVNDFIDT ATRHVLMRQG VLGIKVKIMR DPAKSRTGPK ALPDAVTIIE PKEEEPILAP SVKDY

+
分子 #3: 40S ribosomal protein S5

分子名称: 40S ribosomal protein S5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 22.908338 KDa
配列文字列: FTPVVLATPI PEEVQQAQTE IKLFNKWSFE EVEVKDASLV DYVQVRQPIF VAHTAGRYAN KRFRKAQCPI IERLTNSLMM NGRNNGKKL KAVRIIKHTL DIINVLTDQN PIQVVVDAIT NTGPREDTTR VGGGGAARRQ AVDVSPLRRV NQAIALLTIG A REAAFRNI ...文字列:
FTPVVLATPI PEEVQQAQTE IKLFNKWSFE EVEVKDASLV DYVQVRQPIF VAHTAGRYAN KRFRKAQCPI IERLTNSLMM NGRNNGKKL KAVRIIKHTL DIINVLTDQN PIQVVVDAIT NTGPREDTTR VGGGGAARRQ AVDVSPLRRV NQAIALLTIG A REAAFRNI KTIAETLAEE LINAAKGSST SYAIKKKDEL ERVAKSNR

+
分子 #4: 40S ribosomal protein S10-A

分子名称: 40S ribosomal protein S10-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 11.042562 KDa
配列文字列:
MLMPKEDRNK IHQYLFQEGV VVAKKDFNQA KHEEIDTKNL YVIKALQSLT SKGYVKTQFS WQYYYYTLTE EGVEYLREYL NLPEHIVPG TYI

+
分子 #5: 40S ribosomal protein S12

分子名称: 40S ribosomal protein S12 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 13.327331 KDa
配列文字列:
AEVTIEDALK VVLRTALVHD GLARGLREST KALTRGEALL VVLVSSVTEA NIIKLVEGLA NDPENKVPLI KVADAKQLGE WAGLGKIDR EGNARKVVGA SVVVVKNWGA ETDELSMIME HFSQQ

+
分子 #6: 40S ribosomal protein S15

分子名称: 40S ribosomal protein S15 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 6 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 13.421732 KDa
配列文字列:
THSYRGVDLE KLLEMSTEDF VKLAPARVRR RFARGMTSKP AGFMKKLRAA KLAAPENEKP APVRTHMRNM IIVPEMIGSV VGIYNGKAF NQVEIRPEML GHYLGEFSIT YTPVRHGRAG

+
分子 #7: 40S ribosomal protein S16-A

分子名称: 40S ribosomal protein S16-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 7 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 15.659216 KDa
配列文字列:
AVPSVQTFGK KKSATAVAHV KAGKGLIKVN GSPITLVEPE ILRFKVYEPL LLVGLDKFSN IDIRVRVTGG GHVSQVYAIR QAIAKGLVA YHQKYVDEQS KNELKKAFTS YDRTLLIADS RRPEPKKFGG KGARSRFQKS YR

+
分子 #8: 40S ribosomal protein S17-B

分子名称: 40S ribosomal protein S17-B / タイプ: protein_or_peptide / ID: 8 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 14.268545 KDa
配列文字列:
GRVRTKTVKR ASKALIERYY PKLTLDFQTN KRLCDEIATI QSKRLRNKIA GYTTHLMKRI QKGPVRGISF KLQEEERERK DQYVPEVSA LDLSRSNGVL NVDNQTSDLV KSLGLKLPLS VINVSA

+
分子 #9: 40S ribosomal protein S18-A

分子名称: 40S ribosomal protein S18-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 9 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 16.940443 KDa
配列文字列:
SLVVQEQGSF QHILRLLNTN VDGNIKIVYA LTTIKGVGRR YSNLVCKKAD VDLHKRAGEL TQEELERIVQ IMQNPTHYKI PAWFLNRQN DITDGKDYHT LANNVESKLR DDLERLKKIR AHRGIRHFWG LRVRGQHTKT TGRRRA

+
分子 #10: 40S ribosomal protein S19-A

分子名称: 40S ribosomal protein S19-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 10 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 15.81093 KDa
配列文字列:
PGVSVRDVAA QDFINAYASF LQRQGKLEVP GYVDIVKTSS GNEMPPQDAE GWFYKRAASV ARHIYMRKQV GVGKLNKLYG GAKSRGVRP YKHIDASGSI NRKVLQALEK IGIVEISPKG GRRISENGQR DLDRIAAQTL EEDE

+
分子 #11: 40S ribosomal protein S20

分子名称: 40S ribosomal protein S20 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 11 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 11.476479 KDa
配列文字列:
IIKIRITLTS TKVKQLENVS SNIVKNAEQH NLVKKGPVRL PTKVLKISTR KTPNGEGSKT WETYEMRIHK RYIDLEAPVQ IVKRITQIT IEPGVDVEVV VA

+
分子 #12: 40S ribosomal protein S25-A

分子名称: 40S ribosomal protein S25-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 12 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 7.930299 KDa
配列文字列:
QHAVILDQEK YDRILKEVPT YRYVSVSVLV DRLKIGGSLA RIALRHLEKE GIIKPISKHS KQAIYTRAT

+
分子 #13: 40S ribosomal protein S28-A

分子名称: 40S ribosomal protein S28-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 13 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 7.116281 KDa
配列文字列:
TPVTLAKVIK VLGRTGSRGG VTQVRVEFLE DTSRTIVRNV KGPVRENDIL VLMESEREAR RLR

+
分子 #14: 40S ribosomal protein S29-A

分子名称: 40S ribosomal protein S29-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 14 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 6.335303 KDa
配列文字列:
ENVWFSHPRR YGKGSRQCRV CSSHTGLIRK YGLNICRQCF REKANDIGFN KFR

+
分子 #15: Ubiquitin-40S ribosomal protein S31

分子名称: Ubiquitin-40S ribosomal protein S31 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 15 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 8.329946 KDa
配列文字列:
RKKKVYTTPK KIKHKHKAVK LAVLSYYKVD AEGKVTKLRR ECSNPTCGAG VFLANHKDRL YCGKCHSVYK VNA

+
分子 #16: Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-like protein

分子名称: Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-like protein
タイプ: protein_or_peptide / ID: 16 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 34.151426 KDa
配列文字列: LVLRGTLEGH NGWVTSLATS AGQPNLLLSA SRDKTLISWK LTGDDQKFGV PVRSFKGHSH IVQDCTLTAD GAYALSASWD KTLRLWDVA TGETYQRFVG HKSDVMSVDI DKKASMIISG SRDKTIKVWT IKGQCLATLL GHNDWVSQVR VVPNEAADDD S VTIISAGN ...文字列:
LVLRGTLEGH NGWVTSLATS AGQPNLLLSA SRDKTLISWK LTGDDQKFGV PVRSFKGHSH IVQDCTLTAD GAYALSASWD KTLRLWDVA TGETYQRFVG HKSDVMSVDI DKKASMIISG SRDKTIKVWT IKGQCLATLL GHNDWVSQVR VVPNEAADDD S VTIISAGN DKMVKAWNLN QFQIEADFIG HNSNINTLTA SPDGTLIASA GKDGEIMLWN LAAKKAMYTL SAQDEVFSLA FS PNRYWLA AATATGIKVF SLDPQYLVDD LRPEFAGYSK AAEPHAVSLA WSADGQTLFA GYTDNVIRVW QVMTAN

+
分子 #17: 40S ribosomal protein S0-A

分子名称: 40S ribosomal protein S0-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 17 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 22.811074 KDa
配列文字列: SLPATFDLTP EDAQLLLAAN THLGARNVQV HQEPYVFNAR PDGVHVINVG KTWEKLVLAA RIIAAIPNPE DVVAISSRTF GQRAVLKFA AHTGATPIAG RFTPGSFTNY ITRSFKEPRL VIVTDPRSDA QAIKEASYVN IPVIALTDLD SPSEFVDVAI P CNNRGKHS ...文字列:
SLPATFDLTP EDAQLLLAAN THLGARNVQV HQEPYVFNAR PDGVHVINVG KTWEKLVLAA RIIAAIPNPE DVVAISSRTF GQRAVLKFA AHTGATPIAG RFTPGSFTNY ITRSFKEPRL VIVTDPRSDA QAIKEASYVN IPVIALTDLD SPSEFVDVAI P CNNRGKHS IGLIWYLLAR EVLRLRGALV DRTQPWSIMP DLYFYRDP

+
分子 #18: 40S ribosomal protein S1-A

分子名称: 40S ribosomal protein S1-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 18 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 24.498365 KDa
配列文字列: VVDPFTRKEW FDIKAPSTFE NRNVGKTLVN KSTGLKSASD ALKGRVVEVC LADLQGSEDH SFRKIKLRVD EVQGKNLLTN FHGMDFTTD KLRSMVRKWQ TLIEANVTVK TSDDYVLRIF AIAFTRKQAN QVKRHSYAQS SHIRAIRKVI SEILTKEVQG S TLAQLTSK ...文字列:
VVDPFTRKEW FDIKAPSTFE NRNVGKTLVN KSTGLKSASD ALKGRVVEVC LADLQGSEDH SFRKIKLRVD EVQGKNLLTN FHGMDFTTD KLRSMVRKWQ TLIEANVTVK TSDDYVLRIF AIAFTRKQAN QVKRHSYAQS SHIRAIRKVI SEILTKEVQG S TLAQLTSK LIPEVINKEI ENATKDIFPL QNIHVRKVKL LKQPKFDVGA LMALHGEG

+
分子 #19: 40S ribosomal protein S2

分子名称: 40S ribosomal protein S2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 19 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 23.212979 KDa
配列文字列: GWVPVTKLGR LVKAGKITTI EEIFLHSLPV KEFQIIDTLL PGLQDEVMNI KPVQKQTRAG QRTRFKAVVV VGDSNGHVGL GIKTAKEVA GAIRAGIIIA KLSVIPIRRG YWGTNLGQPH SLATKTTGKC GSVTVRLIPA PRGSGIVASP AVKKLLQLAG V EDVYTQSN ...文字列:
GWVPVTKLGR LVKAGKITTI EEIFLHSLPV KEFQIIDTLL PGLQDEVMNI KPVQKQTRAG QRTRFKAVVV VGDSNGHVGL GIKTAKEVA GAIRAGIIIA KLSVIPIRRG YWGTNLGQPH SLATKTTGKC GSVTVRLIPA PRGSGIVASP AVKKLLQLAG V EDVYTQSN GKTRTLENTL KAAFVAIGNT YGFLTPNLWA EQPLPVSPLD IYSDEASAQ

+
分子 #20: 40S ribosomal protein S4-A

分子名称: 40S ribosomal protein S4-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 20 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 29.338133 KDa
配列文字列: ARGPKKHLKR LAAPHHWLLD KLSGCYAPRP SAGPHKLRES LPLIVFLRNR LKYALNGREV KAILMQRHVK VDGKVRTDTT YPAGFMDVI TLDATNENFR LVYDVKGRFA VHRITDEEAS YKLGKVKKVQ LGKKGVPYVV THDGRTIRYP DPNIKVNDTV K IDLASGKI ...文字列:
ARGPKKHLKR LAAPHHWLLD KLSGCYAPRP SAGPHKLRES LPLIVFLRNR LKYALNGREV KAILMQRHVK VDGKVRTDTT YPAGFMDVI TLDATNENFR LVYDVKGRFA VHRITDEEAS YKLGKVKKVQ LGKKGVPYVV THDGRTIRYP DPNIKVNDTV K IDLASGKI TDFIKFDAGK LVYVTGGRNL GRIGTIVHKE RHDGGFDLVH IKDSLDNTFV TRLNNVFVIG EQGKPYISLP KG KGIKLSI AEERDRRRAQ QGL

+
分子 #21: 40S ribosomal protein S6-A

分子名称: 40S ribosomal protein S6-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 21 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 24.965975 KDa
配列文字列: MKLNISYPVN GSQKTFEIDD EHRIRVFFDK RIGQEVDGEA VGDEFKGYVF KISGGNDKQG FPMKQGVLLP TRIKLLLTKN VSCYRPRRD GERKRKSVRG AIVGPDLAVL ALVIVKKGEQ ELEGLTDTTV PKRLGPKRAN NIRKFFGLSK EDDVRDFVIR R EVTKGEKT ...文字列:
MKLNISYPVN GSQKTFEIDD EHRIRVFFDK RIGQEVDGEA VGDEFKGYVF KISGGNDKQG FPMKQGVLLP TRIKLLLTKN VSCYRPRRD GERKRKSVRG AIVGPDLAVL ALVIVKKGEQ ELEGLTDTTV PKRLGPKRAN NIRKFFGLSK EDDVRDFVIR R EVTKGEKT YTKAPKIQRL VTPQRLQRKR HQRALKVRNA QAQREAAAEY AQLLAKRLSE

+
分子 #22: 40S ribosomal protein S7-A

分子名称: 40S ribosomal protein S7-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 22 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 21.07157 KDa
配列文字列:
APQAKILSQA PTELELQVAQ AFVELENSSP ELKAELRPLQ FKSIREIDVA GGKKALAIFV PVPSLAGFHK VQTKLTRELE KKFQDRHVI FLAERRILPK PSRTSRQVQK RPRSRTLTAV HDKILEDLVF PTEIVGKRVR YLVGGNKIQK VLLDSKDVQQ I DYKLESFQ AVYNKLTGKQ IVFEIPS

+
分子 #23: 40S ribosomal protein S8-A

分子名称: 40S ribosomal protein S8-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 23 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 21.14718 KDa
配列文字列:
GISRDSRHKR SATGAKRAQF RKKRKFELGR QPANTKIGAK RIHSVRTRGG NKKYRALRIE TGNFSWASEG ISKKTRIAGV VYHPSNNEL VRTNTLTKAA IVQIDATPFR QWFEAHYGQT LGKKSKNAER KWAARAASAK IESSVESQFS AGRLYACISS R PGQSGRCD GYILEGEELA FYLRRLTAKK

+
分子 #24: 40S ribosomal protein S9-A

分子名称: 40S ribosomal protein S9-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 24 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 21.210662 KDa
配列文字列:
PRAPRTYSKT YSTPKRPYES SRLDAELKLA GEFGLKNKKE IYRISFQLSK IRRAARDLLT RDEKDPKRLF EGNALIRRLV RVGVLSEDK KKLDYVLALK VEDFLERRLQ TQVYKLGLAK SVHHARVLIT QRHIAVGKQI VNIPSFMVRL DSEKHIDFAP T SPFGGARP GRVARRNAAR KAEASGE

+
分子 #25: 40S ribosomal protein S11-A

分子名称: 40S ribosomal protein S11-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 25 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 16.588461 KDa
配列文字列:
STELTVQSER AFQKQPHIFN NPKVKTSKRT KRWYKNAGLG FKTPKTAIEG SYIDKKCPFT GLVSIRGKIL TGTVVSTKMH RTIVIRRAY LHYIPKYNRY EKRHKNVPVH VSPAFRVQVG DIVTVGQCRP ISKTVRFNVV KVSAAAG

+
分子 #26: 40S ribosomal protein S13

分子名称: 40S ribosomal protein S13 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 26 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 16.928748 KDa
配列文字列:
GRMHSAGKGI SSSAIPYSRN APAWFKLSSE SVIEQIVKYA RKGLTPSQIG VLLRDAHGVT QARVITGNKI MRILKSNGLA PEIPEDLYY LIKKAVSVRK HLERNRKDKD AKFRLILIES RIHRLARYYR TVAVLPPNWK YESATASALV N

+
分子 #27: 40S ribosomal protein S14-B

分子名称: 40S ribosomal protein S14-B / タイプ: protein_or_peptide / ID: 27 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 13.560528 KDa
配列文字列:
NSQVFGVARI YASFNDTFVH VTDLSGKETI ARVTGGMKVK ADRDESSPYA AMLAAQDVAA KCKEVGITAV HVKIRATGGT RTKTPGPGG QAALRALARS GLRIGRIEDV TPVPSDSTRK KGGRRGRRL

+
分子 #28: 40S ribosomal protein S21-A

分子名称: 40S ribosomal protein S21-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 28 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 9.758829 KDa
配列文字列:
MENDKGQLVE LYVPRKCSAT NRIIKADDHA SVQINVAKVD EEGRAIPGEY VTYALSGYVR SRGESDDSLN RLAQNDGLLK NVWSYSR

+
分子 #29: 40S ribosomal protein S22-A

分子名称: 40S ribosomal protein S22-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 29 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 14.518867 KDa
配列文字列:
TRSSVLADAL NAINNAEKTG KRQVLIRPSS KVIIKFLQVM QKHGYIGEFE YIDDHRSGKI VVQLNGRLNK CGVISPRFNV KIGDIEKWT ANLLPARQFG YVILTTSAGI MDHEEARRKH VSGKILGFVY

+
分子 #30: 40S ribosomal protein S23-A

分子名称: 40S ribosomal protein S23-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 30 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 15.942699 KDa
配列文字列:
GKGKPRGLNS ARKLRVHRRN NRWAENNYKK RLLGTAFKSS PFGGSSHAKG IVLEKLGIES KQPNSAIRKC VRVQLIKNGK KVTAFVPND GCLNFVDEND EVLLAGFGRK GKAKGDIPGV RFKVVKVSGV SLLALWKEKK EKPRS

+
分子 #31: 40S ribosomal protein S24-A

分子名称: 40S ribosomal protein S24-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 31 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 15.23165 KDa
配列文字列:
SDAVTIRTRK VISNPLLARK QFVVDVLHPN RANVSKDELR EKLAEVYKAE KDAVSVFGFR TQFGGGKSVG FGLVYNSVAE AKKFEPTYR LVRYGLAEKV EKASRQQRKQ KKNRDKKIFG TGKRLAKKVA RRNAD

+
分子 #32: 40S ribosomal protein S26-B

分子名称: 40S ribosomal protein S26-B / タイプ: protein_or_peptide / ID: 32 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 11.022989 KDa
配列文字列:
PKKRASNGRN KKGRGHVKPV RCVNCSKSIP KDKAIKRMAI RNIVEAAAVR DLSEASVYPE YALPKTYNKL HYCVSCAIHA RIVRVRSRE DRKNRAPP

+
分子 #33: 40S ribosomal protein S27-A

分子名称: 40S ribosomal protein S27-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 33 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 8.762195 KDa
配列文字列:
VLVQDLLHPT AASEARKHKL KTLVQGPRSY FLDVKCPGCL NITTVFSHAQ TAVTCESCST ILCTPTGGKA KLSEGTSFRR K

+
分子 #34: 40S ribosomal protein S30-A

分子名称: 40S ribosomal protein S30-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 34 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 5.054081 KDa
配列文字列:
AKVHGSLARA GKVKSQTPKV EKTEKPKKPK GRAYKRLLYT RRFV

+
分子 #35: Multiprotein-bridging factor 1

分子名称: Multiprotein-bridging factor 1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 35 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 13.247083 KDa
配列文字列:
ARSQGQINAA RRQGLVVSVD KKYGSTNTRG DNEGQRLTKV DRETDIVKPK KLDPNVGRAI SRARTDKKMS QKDLATKINE KPTVVNDYE AARAIPNQQV LSKLERALGV KLRGNNIGSP L

+
分子 #42: 60S ribosomal protein L2-A

分子名称: 60S ribosomal protein L2-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 42 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 27.089158 KDa
配列文字列: GRVIRNQRKG AGSIFTSHTR LRQGAAKLRT LDYAERHGYI RGIVKQIVHD SGRGAPLAKV VFRDPYKYRL REEIFIANEG VHTGQFIYA GKKASLNVGN VLPLGSVPEG TIVSNVEEKP GDRGALARAS GNYVIIIGHN PDENKTRVRL PSGAKKVISS D ARGVIGVI ...文字列:
GRVIRNQRKG AGSIFTSHTR LRQGAAKLRT LDYAERHGYI RGIVKQIVHD SGRGAPLAKV VFRDPYKYRL REEIFIANEG VHTGQFIYA GKKASLNVGN VLPLGSVPEG TIVSNVEEKP GDRGALARAS GNYVIIIGHN PDENKTRVRL PSGAKKVISS D ARGVIGVI AGGGRVDKPL LKAGRAFHKY RLKRNSWPKT RGVAMNPVDH PHGGGNHQHI GKASTISRGA VSGQKAGLIA AR RTGLLRG SQKT

+
分子 #43: 60S ribosomal protein L3

分子名称: 60S ribosomal protein L3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 43 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 43.719602 KDa
配列文字列: SHRKYEAPRH GHLGFLPRKR AASIRARVKA FPKDDRSKPV ALTSFLGYKA GMTTIVRDLD RPGSKFHKRE VVEAVTVVDT PPVVVVGVV GYVETPRGLR SLTTVWAEHL SDEVKRRFYK NWYKSKKKAF TKYSAKYAQD GAGIERELAR IKKYASVVRV L VHTQIRKT ...文字列:
SHRKYEAPRH GHLGFLPRKR AASIRARVKA FPKDDRSKPV ALTSFLGYKA GMTTIVRDLD RPGSKFHKRE VVEAVTVVDT PPVVVVGVV GYVETPRGLR SLTTVWAEHL SDEVKRRFYK NWYKSKKKAF TKYSAKYAQD GAGIERELAR IKKYASVVRV L VHTQIRKT PLAQKKAHLA EIQLNGGSIS EKVDWAREHF EKTVAVDSVF EQNEMIDAIA VTKGHGFEGV THRWGTKKLP RK THRGLRK VACIGAWHPA HVMWSVARAG QRGYHSRTSI NHKIYRVGKG DDEANGATSF DRTKKTITPM GGFVHYGEIK NDF IMVKGC IPGNRKRIVT LRKSLYTNTS RKALEEVSLK WIDTASKFGK GRFQTPAEKH AFMGTLKKDL

+
分子 #44: 60S ribosomal protein L4-A

分子名称: 60S ribosomal protein L4-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 44 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 39.027926 KDa
配列文字列: SRPQVTVHSL TGEATANALP LPAVFSAPIR PDIVHTVFTS VNKNKRQAYA VSEKAGHQTS AESWGTGRAV ARIPRVGGGG TGRSGQGAF GNMCRGGRMF APTKTWRKWN VKVNHNEKRY ATASAIAATA VASLVLARGH RVEKIPEIPL VVSTDLESIQ K TKEAVAAL ...文字列:
SRPQVTVHSL TGEATANALP LPAVFSAPIR PDIVHTVFTS VNKNKRQAYA VSEKAGHQTS AESWGTGRAV ARIPRVGGGG TGRSGQGAF GNMCRGGRMF APTKTWRKWN VKVNHNEKRY ATASAIAATA VASLVLARGH RVEKIPEIPL VVSTDLESIQ K TKEAVAAL KAVGAHSDLL KVLKSKKLRA GKGKYRNRRW TQRRGPLVVY AEDNGIVKAL RNVPGVETAN VASLNLLQLA PG AHLGRFV IWTEAAFTKL DQVWGSETVA SSKVGYTLPS HIISTSDVTR IINSSEIQSA IRPAGQATQK RTHVLKKNPL KNK QVLLRL NPYAKVFAAE KLGSKKAEKT GTKPAAVFTE TLKHD

+
分子 #45: 60S ribosomal protein L5

分子名称: 60S ribosomal protein L5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 45 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 33.415387 KDa
配列文字列: QKDAKSSAYS SRFQTPFRRR REGKTDYYQR KRLVTQHKAK YNTPKYRLVV RFTNKDIICQ IISSTITGDV VLAAAYSHEL PRYGITHGL TNWAAAYATG LLIARRTLQK LGLDETYKGV EEVEGEYELT EAVEDGPRPF KVFLDIGLQR TTTGARVFGA L KGASDGGL ...文字列:
QKDAKSSAYS SRFQTPFRRR REGKTDYYQR KRLVTQHKAK YNTPKYRLVV RFTNKDIICQ IISSTITGDV VLAAAYSHEL PRYGITHGL TNWAAAYATG LLIARRTLQK LGLDETYKGV EEVEGEYELT EAVEDGPRPF KVFLDIGLQR TTTGARVFGA L KGASDGGL YVPHSENRFP GWDFETEEID PELLRSYIFG GHVSQYMEEL ADDDEERFSE LFKGYLADDI DADSLEDIYT SA HEAIRAD PAFKPTEKKF TKEQYAAESK KYRQTKLSKE ERAARVAAKI AALAGQQ

+
分子 #46: 60S ribosomal protein L6-B

分子名称: 60S ribosomal protein L6-B / タイプ: protein_or_peptide / ID: 46 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 18.93532 KDa
配列文字列:
TAQQAPKWYP SEDVAAPKKT RKAVRPQKLR ASLVPGTVLI LLAGRFRGKR VVYLKHLEDN TLLVTGPFKV NGVPLRRVNA RYVIATSTK VSVEGVNVEK FNVEYFAKEK LTKKEKKEAK EIKTERVEDQ KVVDKALLAE IKKTPLLKQY LSASFSLKNG D KPHLLKF

+
分子 #47: 60S ribosomal protein L7-A

分子名称: 60S ribosomal protein L7-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 47 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 25.240377 KDa
配列文字列: AEQVAAERAA RKAANKEKRA IILERNAAYQ KEYETAERNI IQAKRDAKAA GSYYVEAQHK LVFVVRIKGI NKIPPKPRKV LQLLRLTRI NSGTFVKVTK ATLELLKLIE PYVAYGYPSY STIRQLVYKR GFGKINKQRV PLSDNAIIEA NLGKYGILSI D DLIHEIIT ...文字列:
AEQVAAERAA RKAANKEKRA IILERNAAYQ KEYETAERNI IQAKRDAKAA GSYYVEAQHK LVFVVRIKGI NKIPPKPRKV LQLLRLTRI NSGTFVKVTK ATLELLKLIE PYVAYGYPSY STIRQLVYKR GFGKINKQRV PLSDNAIIEA NLGKYGILSI D DLIHEIIT VGPHFKQANN FLWPFKLSNP SGGWGVPRKF KHFIQGGSFG NREEFINKLV KSMN

+
分子 #48: 60S ribosomal protein L8-A

分子名称: 60S ribosomal protein L8-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 48 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 25.814998 KDa
配列文字列: NPLTHSTPKN FGIGQAVQPK RNLSRYVKWP EYVRVQRQKK ILSIRLKVPP TIAQFQYTLD RNTAAETFKL FNKYRPETAA EKKERLTKE AAAVAEGKSK QDASPKPYAV KYGLNHVVAL IENKKAKLVL IANDVDPIEL VVFLPALCKK MGVPYAIVKG K ARLGTLVN ...文字列:
NPLTHSTPKN FGIGQAVQPK RNLSRYVKWP EYVRVQRQKK ILSIRLKVPP TIAQFQYTLD RNTAAETFKL FNKYRPETAA EKKERLTKE AAAVAEGKSK QDASPKPYAV KYGLNHVVAL IENKKAKLVL IANDVDPIEL VVFLPALCKK MGVPYAIVKG K ARLGTLVN QKTSAVAALT EVRAEDEAAL AKLVSTIDAN FADKYDEVKK HWGGGILGNK AQAKMDKRAK NSDSA

+
分子 #49: 60S ribosomal protein L9-A

分子名称: 60S ribosomal protein L9-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 49 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 21.605061 KDa
配列文字列: MKYIQTEQQI EVPEGVTVSI KSRIVKVVGP RGTLTKNLKH IDVTFTKVNN QLIKVAVHNG GRKHVAALRT VKSLVDNMIT GVTKGYKYK MRYVYAHFPI NVNIVEKDGA KFIEVRNFLG DKKIRNVPVR DGVTIEFSTN VKDEIVLSGN SVEDVSQNAA D LQQICRVR ...文字列:
MKYIQTEQQI EVPEGVTVSI KSRIVKVVGP RGTLTKNLKH IDVTFTKVNN QLIKVAVHNG GRKHVAALRT VKSLVDNMIT GVTKGYKYK MRYVYAHFPI NVNIVEKDGA KFIEVRNFLG DKKIRNVPVR DGVTIEFSTN VKDEIVLSGN SVEDVSQNAA D LQQICRVR NKDIRKFLDG IYVSHKGFIT EDL

+
分子 #50: 60S ribosomal protein L10

分子名称: 60S ribosomal protein L10 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 50 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 25.080062 KDa
配列文字列: ARRPARCYRY QKNKPYPKSR YNRAVPDSKI RIYDLGKKKA TVDEFPLCVH LVSNELEQLS SEALEAARIC ANKYMTTVSG RDAFHLRVR VHPFHVLRIN KMLSCAGADR LQQGMRGAWG KPHGLAARVD IGQIIFSVRT KDSNKDVVVE GLRRARYKFP G QQKIILSK ...文字列:
ARRPARCYRY QKNKPYPKSR YNRAVPDSKI RIYDLGKKKA TVDEFPLCVH LVSNELEQLS SEALEAARIC ANKYMTTVSG RDAFHLRVR VHPFHVLRIN KMLSCAGADR LQQGMRGAWG KPHGLAARVD IGQIIFSVRT KDSNKDVVVE GLRRARYKFP G QQKIILSK KWGFTNLDRP EYLKKREAGE VKDDGAFVKF LSKKGSLENN IREFPEYFAA

+
分子 #51: 60S ribosomal protein L11-B

分子名称: 60S ribosomal protein L11-B / タイプ: protein_or_peptide / ID: 51 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 19.266082 KDa
配列文字列:
QNPMRDLKIE KLVLNISVGE SGDRLTRASK VLEQLSGQTP VQSKARYTVR TFGIRRNEKI AVHVTVRGPK AEEILERGLK VKEYQLRDR NFSATGNFGF GIDEHIDLGI KYDPSIGIFG MDFYVVMNRP GARVTRRKRC KGTVGNSHKT TKEDTVSWFK Q KYDADVLD K

+
分子 #52: 60S ribosomal protein L13-A

分子名称: 60S ribosomal protein L13-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 52 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 21.885234 KDa
配列文字列: AISKNLPILK NHFRKHWQER VKVHFDQAGK KVSRRNARAT RAAKIAPRPL DLLRPVVRAP TVKYNRKVRA GRGFTLAEVK AAGLTAAYA RTIGIAVDHR RQNRNQEIFD ANVQRLKEYQ SKIIVFPRNG KAPEAEQVLS AAATFPIAQP ATDVEARAVQ D NGESAFRT ...文字列:
AISKNLPILK NHFRKHWQER VKVHFDQAGK KVSRRNARAT RAAKIAPRPL DLLRPVVRAP TVKYNRKVRA GRGFTLAEVK AAGLTAAYA RTIGIAVDHR RQNRNQEIFD ANVQRLKEYQ SKIIVFPRNG KAPEAEQVLS AAATFPIAQP ATDVEARAVQ D NGESAFRT LRLARSEKKF RGIREKRARE KAEAE

+
分子 #53: 60S ribosomal protein L14-A

分子名称: 60S ribosomal protein L14-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 53 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 14.976794 KDa
配列文字列:
TDSIVKASNW RLVEVGRVVL IKKGQSAGKL AAIVEIIDQK KVLIDGPKAG VPRQAINLGQ VVLTPLTFAL PRGARTATVS KKWAAAAVC EKWAASSWAK KIAQRERRAA LTDFERFQVM VLRKQKRYTV KKALAKA

+
分子 #54: 60S ribosomal protein L15-A

分子名称: 60S ribosomal protein L15-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 54 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 24.351162 KDa
配列文字列: GAYKYLEELQ RKKQSDVLRF LQRVRVWEYR QKNVIHRAAR PTRPDKARRL GYKAKQGFVI YRVRVRRGNR KRPVPKGATY GKPTNQGVN ELKYQRSLRA TAEERVGRRA ANLRVLNSYW VNQDSTYKYF EVILVDPQHK AIRRDARYNW ICDPVHKHRE A RGLTATGK ...文字列:
GAYKYLEELQ RKKQSDVLRF LQRVRVWEYR QKNVIHRAAR PTRPDKARRL GYKAKQGFVI YRVRVRRGNR KRPVPKGATY GKPTNQGVN ELKYQRSLRA TAEERVGRRA ANLRVLNSYW VNQDSTYKYF EVILVDPQHK AIRRDARYNW ICDPVHKHRE A RGLTATGK KSRGINKGHK FNNTKAGRRK TWKRQNTLSL WRYRK

+
分子 #55: 60S ribosomal protein L16-A

分子名称: 60S ribosomal protein L16-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 55 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 22.028951 KDa
配列文字列: VEPVVVIDGK GHLVGRLASV VAKQLLNGQK IVVVRAEELN ISGEFFRNKL KYHDFLRKAT AFNKTRGPFH FRAPSRIFYK ALRGMVSHK TARGKAALER LKVFEGIPPP YDKKKRVVVP QALRVLRLKP GRKYTTLGKL STSVGWKYED VVAKLEAKRK V SSAEYYAK ...文字列:
VEPVVVIDGK GHLVGRLASV VAKQLLNGQK IVVVRAEELN ISGEFFRNKL KYHDFLRKAT AFNKTRGPFH FRAPSRIFYK ALRGMVSHK TARGKAALER LKVFEGIPPP YDKKKRVVVP QALRVLRLKP GRKYTTLGKL STSVGWKYED VVAKLEAKRK V SSAEYYAK KRAFTKKVAS ANATAAESDV AKQLAALGY

+
分子 #56: 60S ribosomal protein L17-A

分子名称: 60S ribosomal protein L17-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 56 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 20.458322 KDa
配列文字列:
ARYGATSTNP AKSASARGSY LRVSFKNTRE TAQAINGWEL TKAQKYLEQV LDHQRAIPFR RFNSSIGRTA QGKEFGVTKA RWPAKSVKF VQGLLQNAAA NAEAKGLDAT KLYVSHIQVN QAPKQRRRTY RAHGRINKYE SSPSHIELVV TEKEEAVAKA A EKKVVRLT SRQRGRIAAQ KRIAA

+
分子 #57: 60S ribosomal protein L18-A

分子名称: 60S ribosomal protein L18-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 57 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 20.478059 KDa
配列文字列:
GIDHTSKQHK RSGHRTAPKS DNVYLKLLVK LYTFLARRTD APFNKVVLKA LFLSKINRPP VSVSRIARAL KQEGAANKTV VVVGTVTDD ARIFEFPKTT VAALRFTAGA RAKIVKAGGE CITLDQLAVR APKGQNTLIL RGPRNSREAV RHFGMGPHKG K APRILSTG RKFERARGRR RSKGFKV

+
分子 #58: 60S ribosomal protein L19-A

分子名称: 60S ribosomal protein L19-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 58 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 21.631121 KDa
配列文字列:
ANLRTQKRLA ASVVGVGKRK VWLDPNETSE IAQANSRNAI RKLVKNGTIV KKAVTVHSKS RTRAHAQSKR EGRHSGYGKR KGTREARLP SQVVWIRRLR VLRRLLAKYR DAGKIDKHLY HVLYKESKGN AFKHKRALVE HIIQAKADAQ REKALNEEAE A RRLKNRAA RDRRAQRVAE KRDALLKEDA

+
分子 #59: 60S ribosomal protein L20-A

分子名称: 60S ribosomal protein L20-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 59 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 20.347654 KDa
配列文字列:
AHFKEYQVIG RRLPTESVPE PKLFRMRIFA SNEVIAKSRY WYFLQKLHKV KKASGEIVSI NQINEAHPTK VKNFGVWVRY DSRSGTHNM YKEIRDVSRV AAVETLYQDM AARHRARFRS IHILKVAEIE KTADVKRQYV KQFLTKDLKF PLPHRVQKST K TFSYKRPS TFY

+
分子 #60: 60S ribosomal protein L21-A

分子名称: 60S ribosomal protein L21-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 60 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 18.148066 KDa
配列文字列:
GKSHGYRSRT RYMFQRDFRK HGAVHLSTYL KVYKVGDIVD IKANGSIQKG MPHKFYQGKT GVVYNVTKSS VGVIINKMVG NRYLEKRLN LRVEHIKHSK CRQEFLERVK ANAAKRAEAK AQGVAVQLKR QPAQPRESRI VSTEGNVPQT LAPVPYETFI

+
分子 #61: 60S ribosomal protein L22-A

分子名称: 60S ribosomal protein L22-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 61 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 11.263863 KDa
配列文字列:
QKIAKTFTVD VSSPTENGVF DPASYAKYLI DHIKVEGAVG NLGNAVTVTE DGTVVTVVST AKFSGKYLKY LTKKYLKKNQ LRDWIRFVS TKTNEYRLAF Y

+
分子 #62: 60S ribosomal protein L23-A

分子名称: 60S ribosomal protein L23-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 62 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 14.362755 KDa
配列文字列:
SGNGAQGTKF RISLGLPVGA IMNCADNSGA RNLYIIAVKG SGSRLNRLPA ASLGDMVMAT VKKGKPELRK KVMPAIVVRQ AKSWRRRDG VFLYFEDNAG VIANPKGEMK GSAITGPVGK ECADLWPRVA SNSGVVV

+
分子 #63: 60S ribosomal protein L24-A

分子名称: 60S ribosomal protein L24-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 63 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 7.214498 KDa
配列文字列:
MKVEIDSFSG AKIYPGRGTL FVRGDSKIFR FQNSKSASLF KQRKNPRRIA WTVLFRKHHK K

+
分子 #64: 60S ribosomal protein L25

分子名称: 60S ribosomal protein L25 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 64 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 13.771176 KDa
配列文字列:
KALKVRTSAT FRLPKTLKLA RAPKYASKAV PHYNRLDSYK VIEQPITSET AMKKVEDGNI LVFQVSMKAN KYQIKKAVKE LYEVDVLKV NTLVRPNGTK KAYVRLTADY DALDIANRIG YI

+
分子 #65: 60S ribosomal protein L26-A

分子名称: 60S ribosomal protein L26-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 65 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 14.005475 KDa
配列文字列:
AKQSLDVSSD RRKARKAYFT APSSQRRVLL SAPLSKELRA QYGIKALPIR RDDEVLVVRG SKKGQEGKIS SVYRLKFAVQ VDKVTKEKV NGASVPINLH PSKLVITKLH LDKDRKALIQ RKGGKL

+
分子 #66: 60S ribosomal protein L27-A

分子名称: 60S ribosomal protein L27-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 66 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 15.437166 KDa
配列文字列:
AKFLKAGKVA VVVRGRYAGK KVVIVKPHDE GSKSHPFGHA LVAGIERYPL KVTKKHGAKK VAKRTKIKPF IKVVNYNHLL PTRYTLDVE AFKSVVSTET FEQPSQREEA KKVVKKAFEE RHQAGKNQWF FSKLRF

+
分子 #67: 60S ribosomal protein L28

分子名称: 60S ribosomal protein L28 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 67 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 16.630471 KDa
配列文字列:
PSRFTKTRKH RGHVSAGKGR IGKHRKHPGG RGMAGGQHHH RINMDKYHPG YFGKVGMRYF HKQQAHFWKP VLNLDKLWTL IPEDKRDQY LKSASKETAP VIDTLAAGYG KILGKGRIPN VPVIVKARFV SKLAEEKIRA AGGVVELIA

+
分子 #68: 60S ribosomal protein L29

分子名称: 60S ribosomal protein L29 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 68 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 6.560688 KDa
配列文字列:
AKSKNHTAHN QTRKAHRNGI KKPKTYKYPS LKGVDPKFRR NHKHALHGTA KALAAAKK

+
分子 #69: 60S ribosomal protein L30

分子名称: 60S ribosomal protein L30 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 69 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 10.487266 KDa
配列文字列:
SINQKLALVI KSGKYTLGYK STVKSLRQGK SKLIIIAANT PVLRKSELEY YAMLSKTKVY YFQGGNNELG TAVGKLFRVG VVSILEAGD SDILTTL

+
分子 #70: 60S ribosomal protein L31-A

分子名称: 60S ribosomal protein L31-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 70 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 12.649754 KDa
配列文字列:
LKDVVTREYT INLHKRLHGV SFKKRAPRAV KEIKKFAKLH MGTDDVRLAP ELNQAIWKRG VKGVEYRLRL RISRKRNEEE DAKNPLFSY VEPVLVASAK GLQTVVVEED

+
分子 #71: 60S ribosomal protein L32

分子名称: 60S ribosomal protein L32 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 71 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 14.478054 KDa
配列文字列:
ASLPHPKIVK KHTKKFKRHH SDRYHRVAEN WRKQKGIDSV VRRRFRGNIS QPKIGYGSNK KTKFLSPSGH KTFLVANVKD LETLTMHTK TYAAEIAHNI SAKNRVVILA RAKALGIKVT NPKGRLAL

+
分子 #72: 60S ribosomal protein L33-A

分子名称: 60S ribosomal protein L33-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 72 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 12.045935 KDa
配列文字列:
AESHRLYVKG KHLSYQRSKR VNNPNVSLIK IEGVATPQDA QFYLGKRIAY VYRASKEVRG SKIRVMWGKV TRTHGNSGVV RATFRNNLP AKTFGASVRI FLYPSNI

+
分子 #73: 60S ribosomal protein L34-A

分子名称: 60S ribosomal protein L34-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 73 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 12.608831 KDa
配列文字列:
AQRVTFRRRN PYNTRSNKIK VVKTPGGILR AQHVKKLATR PKCGDCGSAL QGISTLRPRQ YATVSKTHKT VSRAYGGSRC ANCVKERII RAFLIEEQKI VKKVVKEQTE AAK

+
分子 #74: 60S ribosomal protein L35-A

分子名称: 60S ribosomal protein L35-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 74 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 13.811444 KDa
配列文字列:
AGVKAYELRT KSKEQLASQL VDLKKELAEL KVQKLSRPSL PKIKTVRKSI ACVLTVINEQ QREAVRQLYK GKKYQPKDLR AKKTRALRR ALTKFEASQV TEKQRKKQIA FPQRKYAIKA

+
分子 #75: 60S ribosomal protein L36-A

分子名称: 60S ribosomal protein L36-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 75 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 11.020063 KDa
配列文字列:
TVKTGIAIGL NKGKKVTSMT PAPKISYKKG AASNRTKFVR SLVREIAGLS PYERRLIDLI RNSGEKRARK VAKKRLGSFT RAKAKVEEM NNIIAASRRH

+
分子 #76: 60S ribosomal protein L37-A

分子名称: 60S ribosomal protein L37-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 76 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 9.229632 KDa
配列文字列:
GKGTPSFGKR HNKSHTLCNR CGRRSFHVQK KTCSSCGYPA AKTRSYNWGA KAKRRHTTGT GRMRYLKHVS RRFKNGFQTG S

+
分子 #77: 60S ribosomal protein L38

分子名称: 60S ribosomal protein L38 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 77 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 8.714363 KDa
配列文字列:
AREITDIKQF LELTRRADVK TATVKINKKL NKAGKPFRQT KFKVRGSSSL YTLVINDAGK AKKLIQSLPP TLKVNRL

+
分子 #78: 60S ribosomal protein L39

分子名称: 60S ribosomal protein L39 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 78 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 6.227444 KDa
配列文字列:
AAQKSFRIKQ KMAKAKKQNR PLPQWIRLRT NNTIRYNAKR RNWRRTKMNI

+
分子 #79: Ubiquitin-60S ribosomal protein L40

分子名称: Ubiquitin-60S ribosomal protein L40 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 79 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 6.032321 KDa
配列文字列:
IIEPSLKALA SKYNCDKSVC RKCYARLPPR ATNCRKRKCG HTNQLRPKKK LK

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分子 #80: 60S ribosomal protein L41-B

分子名称: 60S ribosomal protein L41-B / タイプ: protein_or_peptide / ID: 80 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 3.354243 KDa
配列文字列:
MRAKWRKKRT RRLKRKRRKV RARSK

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分子 #81: 60S ribosomal protein L42-A

分子名称: 60S ribosomal protein L42-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 81 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 11.840159 KDa
配列文字列:
VNVPKTRKTY CKGKTCRKHT QHKVTQYKAG KASLFAQGKR RYDRKQSGFG GQTKPVFHKK AKTTKKVVLR LECVKCKTRA QLTLKRCKH FELGGEKKQK GQAL

+
分子 #82: 60S ribosomal protein L43-A

分子名称: 60S ribosomal protein L43-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 82 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 9.981756 KDa
配列文字列:
AKRTKKVGIT GKYGVRYGSS LRRQVKKLEI QQHARYDCSF CGKKTVKRGA AGIWTCSCCK KTVAGGAYTV STAAAATVRS TIRRLREMV EA

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実験情報

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構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析単粒子再構成法
試料の集合状態particle

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試料調製

緩衝液pH: 7.5
グリッドモデル: Quantifoil R3/3 / 材質: COPPER / メッシュ: 300 / 支持フィルム - 材質: CARBON / 支持フィルム - トポロジー: CONTINUOUS / 支持フィルム - Film thickness: 300.0 nm
凍結凍結剤: ETHANE-PROPANE

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電子顕微鏡法

顕微鏡FEI TITAN KRIOS
電子線加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系照射モード: SPOT SCAN / 撮影モード: BRIGHT FIELDBright-field microscopy
撮影フィルム・検出器のモデル: FEI FALCON II (4k x 4k)
平均電子線量: 2.5 e/Å2
実験機器
モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company

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画像解析

初期 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD
最終 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD
最終 再構成想定した対称性 - 点群: C1 (非対称) / 解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 4.36 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 3.0) / 使用した粒子像数: 30016
FSC曲線 (解像度の算出)

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原子モデル構築 1

精密化空間: REAL / プロトコル: RIGID BODY FIT
得られたモデル

PDB-7nrd:
Structure of the yeast Gcn1 bound to a colliding stalled 80S ribosome with MBF1, A/P-tRNA and P/E-tRNA

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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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