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検索結果

検索 (著者・登録者: yamaguchi & t)の結果70件中、1から50件目までを表示しています

EMDB-34791:
Doublet microtubule of zebrafish sperm axoneme, WT
手法: サブトモグラム平均 / : Yamaguchi H, Kikkawa M

EMDB-34792:
Radial spoke 1 of zebrafish sperm axoneme, WT
手法: サブトモグラム平均 / : Yamaguchi H, Kikkawa M

EMDB-34793:
Radial spoke 2 of zebrafish sperm axoneme, WT
手法: サブトモグラム平均 / : Yamaguchi H, Kikkawa M

EMDB-34794:
Radial spoke 3 of zebrafish sperm axoneme, WT
手法: サブトモグラム平均 / : Yamaguchi H, Kikkawa M

EMDB-34795:
Doublet microtubule of zebrafish sperm axoneme, calaxin-/-, OAD+ class
手法: サブトモグラム平均 / : Yamaguchi H, Kikkawa M

EMDB-34796:
Doublet microtubule of zebrafish sperm axoneme, calaxin-/-, OAD- class
手法: サブトモグラム平均 / : Yamaguchi H, Kikkawa M

EMDB-34797:
Doublet microtubule of zebrafish sperm axoneme, armc4-/-
手法: サブトモグラム平均 / : Yamaguchi H, Kikkawa M

EMDB-34798:
Outer arm dynein of zebrafish sperm axoneme, WT
手法: サブトモグラム平均 / : Yamaguchi H, Kikkawa M

EMDB-34799:
Outer arm dynein of zebrafish sperm axoneme, WT, refined focusing on the docking complex
手法: サブトモグラム平均 / : Yamaguchi H, Kikkawa M

EMDB-34800:
Outer arm dynein of zebrafish sperm axoneme, WT, 1 mM calcium condition, refined focusing on the docking complex
手法: サブトモグラム平均 / : Yamaguchi H, Kikkawa M

EMDB-34801:
Outer arm dynein of zebrafish sperm axoneme, calaxin-/-, refined focusing on the docking complex
手法: サブトモグラム平均 / : Yamaguchi H, Kikkawa M

EMDB-34802:
Outer arm dynein of zebrafish sperm axoneme, calaxin-/-, incubated with recombinant Calaxin protein, refined focusing on the docking complex
手法: サブトモグラム平均 / : Yamaguchi H, Kikkawa M

EMDB-33200:
Cryo-EM structure of human DNMT1 (aa:351-1616) in complex with ubiquitinated H3 and hemimethylated DNA analog (CXXC-ordered form)
手法: 単粒子 / : Onoda H, Kikuchi A, Kori S, Yoshimi S, Yamagata A, Arita K

EMDB-33201:
Cryo-EM structure of human DNMT1 (aa:351-1616) in complex with ubiquitinated H3 and hemimethylated DNA analog (CXXC-disordered form)
手法: 単粒子 / : Onoda H, Kikuchi A, Kori S, Yoshimi S, Yamagata A, Arita K

EMDB-33298:
Cryo-EM map of apo-DNMT1 (aa:351-1616)
手法: 単粒子 / : Onoda H, Kikuchi A, Kori S, Yoshimi S, Yamagata A, Matsuzawa S, Arita K

EMDB-33299:
Cryo-EM map of DNMT1 (aa:351-1616) in complex with ubiquitinated H3
手法: 単粒子 / : Onoda H, Kikuchi A, Kori S, Yoshimi S, Yamagata A, Arita K

PDB-7xi9:
Cryo-EM structure of human DNMT1 (aa:351-1616) in complex with ubiquitinated H3 and hemimethylated DNA analog (CXXC-ordered form)
手法: 単粒子 / : Onoda H, Kikuchi A, Kori S, Yoshimi S, Yamagata A, Arita K

PDB-7xib:
Cryo-EM structure of human DNMT1 (aa:351-1616) in complex with ubiquitinated H3 and hemimethylated DNA analog (CXXC-disordered form)
手法: 単粒子 / : Onoda H, Kikuchi A, Kori S, Yoshimi S, Yamagata A, Arita K

EMDB-32078:
Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 spike protein (2-up RBD) bound to neutralizing nanobodies P86
手法: 単粒子 / : Maeda R, Fujita J, Konishi Y, Kazuma Y, Yamazaki H, Anzai I, Yamaguchi K, Kasai K, Nagata K, Yamaoka Y, Miyakawa K, Ryo A, Shirakawa K, Makino F, Matsuura Y, Inoue T, Imura A, Namba K, Takaori-Kondo A

EMDB-32079:
Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 spike protein (3-up RBD) bound to neutralizing nanobodies P86
手法: 単粒子 / : Maeda R, Fujita J, Konishi Y, Kazuma Y, Yamazaki H, Anzai I, Yamaguchi K, Kasai K, Nagata K, Yamaoka Y, Miyakawa K, Ryo A, Shirakawa K, Makino F, Matsuura Y, Inoue T, Imura A, Namba K, Takaori-Kondo A

EMDB-32080:
Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 spike protein (1-up RBD) bound to neutralizing nanobodies P17
手法: 単粒子 / : Maeda R, Fujita J, Konishi Y, Kazuma Y, Yamazaki H, Anzai I, Yamaguchi K, Kasai K, Nagata K, Yamaoka Y, Miyakawa K, Ryo A, Shirakawa K, Makino F, Matsuura Y, Inoue T, Imura A, Namba K, Takaori-Kondo A

EMDB-32081:
Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 spike protein (2-up RBD) bound to neutralizing nanobodies P17
手法: 単粒子 / : Maeda R, Fujita J, Konishi Y, Kazuma Y, Yamazaki H, Anzai I, Yamaguchi K, Kasai K, Nagata K, Yamaoka Y, Miyakawa K, Ryo A, Shirakawa K, Makino F, Matsuura Y, Inoue T, Imura A, Namba K, Takaori-Kondo A

PDB-7vq0:
Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 spike protein (2-up RBD) bound to neutralizing nanobodies P86
手法: 単粒子 / : Maeda R, Fujita J, Konishi Y, Kazuma Y, Yamazaki H, Anzai I, Yamaguchi K, Kasai K, Nagata K, Yamaoka Y, Miyakawa K, Ryo A, Shirakawa K, Makino F, Matsuura Y, Inoue T, Imura A, Namba K, Takaori-Kondo A

EMDB-31741:
Structure of the Dicer-2-R2D2 heterodimer
手法: 単粒子 / : Yamaguchi S, Nishizawa T, Kusakizako T, Yamashita K, Tomita A, Hirano H, Nishimasu H, Nureki O

EMDB-31742:
Structure of the Dicer-2-R2D2 heterodimer bound to small RNA duplex
手法: 単粒子 / : Yamaguchi S, Nishizawa T, Kusakizako T, Yamashita K, Tomita A, Hirano H, Nishimasu H, Nureki O

PDB-7v6b:
Structure of the Dicer-2-R2D2 heterodimer
手法: 単粒子 / : Yamaguchi S, Nishizawa T, Kusakizako T, Yamashita K, Tomita A, Hirano H, Nishimasu H, Nureki O

PDB-7v6c:
Structure of the Dicer-2-R2D2 heterodimer bound to small RNA duplex
手法: 単粒子 / : Yamaguchi S, Nishizawa T, Kusakizako T, Yamashita K, Tomita A, Hirano H, Nishimasu H, Nureki O

EMDB-30398:
CryoEM structure of S.typhimurium flagellar LP ring
手法: 単粒子 / : Yamaguchi T, Makino F, Miyata T, Minamino T, Kato T, Namba K

EMDB-30409:
CryoEM structure of S.typhimurium flagellar hook-basal body (HBB) complex
手法: 単粒子 / : Yamaguchi T, Makino F, Miyata T, Minamino T, Kato T, Namba K

PDB-7clr:
CryoEM structure of S.typhimurium flagellar LP ring
手法: 単粒子 / : Yamaguchi T, Makino F, Miyata T, Minamino T, Kato T, Namba K

EMDB-30007:
Cryo-EM structure of phosphoketolase from Bifidobacterium longum
手法: 単粒子 / : Nakata K, Miyazaki N

PDB-6lxv:
Cryo-EM structure of phosphoketolase from Bifidobacterium longum
手法: 単粒子 / : Nakata K, Miyazaki N, Yamaguchi H, Hirose M, Miyano H, Mizukoshi T, Kashiwagi T, Iwasaki K

EMDB-0730:
CryoEM map and model of Nitrite Reductase at pH 6.2
手法: 単粒子 / : Adachi N, Yamaguchi T, Moriya T, Kawasaki M, Koiwai K, Shinoda A, Yamada Y, Yumoto F, Kohzuma T, Senda T

EMDB-0731:
CryoEM map and model of Nitrite Reductase at pH 8.1
手法: 単粒子 / : Adachi N, Yamaguchi T, Moriya T, Kawasaki M, Koiwai K, Shinoda A, Yamada Y, Yumoto F, Kohzuma T, Senda T

PDB-6knf:
CryoEM map and model of Nitrite Reductase at pH 6.2
手法: 単粒子 / : Adachi N, Yamaguchi T, Moriya T, Kawasaki M, Koiwai K, Shinoda A, Yamada Y, Yumoto F, Kohzuma T, Senda T

PDB-6kng:
CryoEM map and model of Nitrite Reductase at pH 8.1
手法: 単粒子 / : Adachi N, Yamaguchi T, Moriya T, Kawasaki M, Koiwai K, Shinoda A, Yamada Y, Yumoto F, Kohzuma T, Senda T

EMDB-0980:
CryoEM structure of S.typhimurium R-type straight flagellar filament made of FljB (A461V)
手法: 単粒子 / : Yamaguchi T, Toma S

EMDB-9896:
CryoEM structure of S.typhimurium R-type flagellar filament made of FljB (A461V) without domain D3 by masking out
手法: らせん対称 / : Yamaguchi T, Toma S

PDB-6jy0:
CryoEM structure of S.typhimurium R-type straight flagellar filament made of FljB (A461V)
手法: らせん対称 / : Yamaguchi T, Toma S, Terahara N, Miyata T, Minamino T, Ashikara M, Namba K, Kato T

EMDB-0809:
Cryo-electron tomography of Candidatus Prometheoarchaeum syntrophicum strain MK-D1
手法: トモグラフィー / : Imachi H, Nobu MK, Nakahara N, Morono Y, Ogawara M, Takaki Y, Takano Y, Uematsu K, Ikuta T, Ito M, Matsui Y, Miyazaki M, Murata K, Saito Y, Sakai S, Song C, Tasumi E, Yamanaka Y, Yamaguchi T, Kamagata Y, Tamaki H, Takai K

EMDB-0852:
Cryo-electron tomography of Candidatus Prometheoarchaeum syntrophicum strain MK-D1
手法: トモグラフィー / : Imachi H, Nobu MK, Nakahara N, Morono Y, Ogawara M, Takaki Y, Takano Y, Uematsu K, Ikuta T, Ito M, Matsui Y, Miyazaki M, Murata K, Saito Y, Sakai S, Song C, Tasumi E, Yamanaka Y, Yamaguchi T, Kamagata Y, Tamaki H, Takai K

EMDB-9590:
structure of leucine dehydrogenase from Geobacillus stearothermophilus by cryo-EM
手法: 単粒子 / : Yamaguchi H, Kamegawa A, Nakata K, Kashiwagi T, Mizukoshi T, Fujiyoshi Y, Tani K

EMDB-9592:
Structure of NAD+-bound leucine dehydrogenase from Geobacillus stearothermophilus by cryo-EM
手法: 単粒子 / : Yamaguchi H, Kamegawa A, Nakata K, Kashiwagi T, Mizukoshi T, Fujiyoshi Y, Tani K

PDB-6acf:
structure of leucine dehydrogenase from Geobacillus stearothermophilus by cryo-EM
手法: 単粒子 / : Yamaguchi H, Kamegawa A, Nakata K, Kashiwagi T, Mizukoshi T, Fujiyoshi Y, Tani K

PDB-6ach:
Structure of NAD+-bound leucine dehydrogenase from Geobacillus stearothermophilus by cryo-EM
手法: 単粒子 / : Yamaguchi H, Kamegawa A, Nakata K, Kashiwagi T, Mizukoshi T, Fujiyoshi Y, Tani K

EMDB-6954:
Doublet microtubule of zebrafish sperm axoneme, WT
手法: トモグラフィー / : Yamaguchi H, Oda T, Kikkawa M, Takeda H

EMDB-6955:
Doublet microtubule of zebrafish sperm axoneme, pih1d1_null mutant
手法: トモグラフィー / : Yamaguchi H, Oda T, Kikkawa M, Takeda H

EMDB-6956:
Doublet microtubule of zebrafish sperm axoneme, pih1d2_null mutant
手法: トモグラフィー / : Yamaguchi H, Oda T, Kikkawa M, Takeda H

EMDB-6957:
Doublet microtubule of zebrafish sperm axoneme, ktu_null mutant
手法: トモグラフィー / : Yamaguchi H, Oda T, Kikkawa M, Takeda H

EMDB-6958:
Doublet microtubule of zebrafish sperm axoneme, twister_null mutant
手法: トモグラフィー / : Yamaguchi H, Oda T, Kikkawa M, Takeda H

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EMN検索について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2021年10月5日: 温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

  • 2021年のノーベル医学・生理学賞は、温度と触覚の受容体を発見したデビッド・ジュリアスとアーデム・パタポウティアンに共同で授与されました
  • EM Navigatorでは、両先駆者によるクライオEM構造データを見つけることができます

外部リンク:The Nobel Prize in Physiology or Medicine 2021 - NobelPrize.org / Structure data by Ardem Patapoutian / Structure data by David Julius

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

テキストデータのダウンロード

EM Navigatorの以下のサービスのデータが、テキスト形式でダウンロードできるようになりました。ダウンロードしたデータをExcelなどで読み込むことができます。

ページデータフォーマット
EM Navigator 検索検索結果CSV, TSV, JSON
EM Navigator 統計情報表データCSV, TSV

関連情報:EMN検索 / EMN統計情報

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EMN検索

3次元電子顕微鏡データ検索

豊富な検索条件と表示条件で、EMDBとPDBの電子顕微鏡エントリを検索できます。

関連情報:EMDB / PDB / EM Navigator / Q: EM Navigatorの情報源は？ / 万見検索 / 2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

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