二次データベース

English version:Derived database

• eF-site
• eF-surf
• eF-seek
• eProtS
• ProMode
• Molecule of the Month

eF-site

eF-site（エフサイト）は蛋白質の機能部位に関する電子表面形状を見るためのデータベースです。活性部位のコノリー表面（Connolly surface）上に静電ポテンシャルと疎水性を表示します。分子認識機構の解析に用いることができます。

URL: http://ef-site.hgc.jp/eF-site/

eF-surf

eF-surf（エフサーフ）は分子の静電ポテンシャルと分子表面を計算して作成するウェブサービスです。

URL: http://ef-site.hgc.jp/eF-surf/

eF-seek

eF-seek（エフシーク）は似たリガンド結合部位を検索するウェブサービスです。eF-siteデータベースの代表結合部位を、クリーク検索アルゴリズム（clique search algorithm）に基づく独自の方法で検索します。

URL: http://ef-site.hgc.jp/eF-seek/

eProtS

eProtS（イープロッツ）は「蛋白質構造百科事典（Encyclopedia of Protein Structures）」の略です。 一般の方を対象として、分子の構造と機能に関して解説しており、教育用コンテンツとしても利用できます。 wikiに基づくシステムを用いており、記事を閲覧するだけでなく、登録・編集することもできます。

URL: http://www.pdbj.org/eprots/index_ja.cgi

ProMode

ProMode（プロモード）はタンパク質の基準振動解析データベースです。

URL: http://cube.socs.waseda.ac.jp/pages/jsp/ja/index.jsp

Molecule of the Month

Molecule of the Month（今月の分子）はRCSBで提供されている、月替わりの分子構造紹介記事です。 PDBjにて日本語に訳しています。 eProtSと合わせて教育用コンテンツとして利用できます。

URL: http://www.pdbj.org/mom/index.php?l=ja